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目的:筛选子宫内膜癌(EC)的诊断生物标志物,并分析EC中免疫细胞浸润情况.方法:从GEO和TCGA数据库下载EC的表达谱数据集,利用R软件鉴定EC与正常子宫内膜组织的差异表达基因(DEGs),对其进行功能和通路富集分析.构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,筛选关键(hub)基因,并对hub基因进行ROC分析筛选出EC的诊断生物标志物.利用科学的反卷积算法(CIBERSORT)分析EC中免疫细胞浸润情况.结果:共鉴定出448个DEGs和10个hub基因.DEGs主要涉及染色体分离、核分裂等生物学过程,介导趋化因子活性、丝氨酸肽酶活性等分子功能,富集于着丝粒、细胞间桥和细胞外基质.富集的通路主要与"Wnt信号通路""TGF-β信号通路""细胞周期信号通路"及"HIF-1信号通路"相关.hub基因ROC分析结果显示AURKA、NCAPG、CDC20、CENPF和UBE2C具有较高的诊断价值.免疫细胞浸润分析发现CD4+记忆性T细胞和CD8+T细胞可能参与EC发生发展.结论:AURKA、NCAPG、CDC20、CENPF和UBE2C可作为EC的诊断标志物,CD4+记忆性T细胞和CD8+T细胞与EC发生发展密切相关,为EC的分子机制研究提供了新思路.

作者:阿说阿牛;孙丽;曲木金作;伍秋红

来源:中国免疫学杂志 2020 年 36卷 22期

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作者:
阿说阿牛;孙丽;曲木金作;伍秋红
来源:
中国免疫学杂志 2020 年 36卷 22期
标签:
子宫内膜癌 诊断标志物 免疫细胞浸润 分子机制
目的:筛选子宫内膜癌(EC)的诊断生物标志物,并分析EC中免疫细胞浸润情况.方法:从GEO和TCGA数据库下载EC的表达谱数据集,利用R软件鉴定EC与正常子宫内膜组织的差异表达基因(DEGs),对其进行功能和通路富集分析.构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,筛选关键(hub)基因,并对hub基因进行ROC分析筛选出EC的诊断生物标志物.利用科学的反卷积算法(CIBERSORT)分析EC中免疫细胞浸润情况.结果:共鉴定出448个DEGs和10个hub基因.DEGs主要涉及染色体分离、核分裂等生物学过程,介导趋化因子活性、丝氨酸肽酶活性等分子功能,富集于着丝粒、细胞间桥和细胞外基质.富集的通路主要与"Wnt信号通路""TGF-β信号通路""细胞周期信号通路"及"HIF-1信号通路"相关.hub基因ROC分析结果显示AURKA、NCAPG、CDC20、CENPF和UBE2C具有较高的诊断价值.免疫细胞浸润分析发现CD4+记忆性T细胞和CD8+T细胞可能参与EC发生发展.结论:AURKA、NCAPG、CDC20、CENPF和UBE2C可作为EC的诊断标志物,CD4+记忆性T细胞和CD8+T细胞与EC发生发展密切相关,为EC的分子机制研究提供了新思路.