背景与目的:长链非编码RNA(lncRNA)对于胃癌患者的预后判断有着非常显著的影响.本研究旨在通过生物信息学的方法,构建并验证能够准确评估胃癌患者预后的lncRNA预后预测模型.方法:通过癌症基因组图谱(TCGA)数据库、基因型-组织表达数据库(GTEx)获取数据作为用于构建预后模型(建模组),通过基因表达汇编数据库(GEO)获取数据用于验证(验证组).采用R软件中的edgeR包筛选差异表达lncRNA;通过单因素和多因素Cox回归来构建预后模型并计算风险值;按照风险值的大小将患者分为高、低风险组,分析风险值与临床病理参数及预后的关系.用验证组样本对建模组的结果进行验证.结果:共筛选出288个差异表达lncRNA,其中28个与胃癌预后有关(均P＜0.05).10种lncRNA生物标记物(MEG3、DNAJC9-AS1、ACTA2-AS1、C15orf54、LINC01210、OVAAL、POU6F2-AS2、ERICH3-AS1、LINC00326及LINC01526)被鉴定并用于构建预后模型.高风险组的总体生存率以及无病生存率均低于低风险组(均P＜0.01),ROC曲线证实该预测模型有一定的准确性(AUC=0.700).单因素及多因素Cox回归分析显示风险值为独立的预后因子(均P＜0.001).风险值与胃癌T分期(P=0.031)、肿瘤分化程度(P=0.044)存在明显关系.在独立的验证组中,高风险组的总体生存率以及无病生存率同样明显低
作者：周新童；党胜春
来源：中国普通外科杂志 2020 年 29卷 10期
