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目的 分析卵巢癌卡铂耐药基因芯片中卡铂耐药细胞系SKOV3-CB较其亲本SKOV3细胞系差异表达下调的肿瘤抑制基因,并验证其差异表达.方法 应用分子生物信息学方法,分析基因芯片中卵巢癌SKOV3-CB细胞系较SKOV3细胞系差异表达下调两倍以上的基因1554条,筛选出肿瘤抑制基因17个,即:RNASET2,VHL,DLG1,COPS2,NOL7,GGNBP2,RBL1,S100A2, PARG1,PERP,TCF3,DNAJA3,PCGF2,ING1,CYLD,RARRES3,RBBP8,应用荧光定量PCR技术对差异表达进行验证.结果 RNASET2,VHL,DLG1,COPS2,NOL7,RBL1,S100A2,PARG1, PERP,TCF3,DNAJA3,ING1,CYLD,RARRES3,RBBP8基因差异表达下调,下调倍数分别为24.47、65.24、10.81、21.30、72.94、5.95、27.13、1.57、 1.32、12.93、46.80、7.57、14.90、14.00、23.98.GGNBP2,PCGF2,DLG1基因差异表达上调,上调倍数分别为5.76、2.19和17.10,基因芯片差异表达结果与real-time PCR所验证表达下降趋势的结果符合率为82.35

作者:唐兆前;李力;张玮;王琪;唐步坚

来源:中国全科医学 2010 年 13卷 21期

知识库介绍

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作者:
唐兆前;李力;张玮;王琪;唐步坚
来源:
中国全科医学 2010 年 13卷 21期
标签:
卵巢肿瘤 抗药性,肿瘤 芯片分析技术 基因,肿瘤抑制
目的 分析卵巢癌卡铂耐药基因芯片中卡铂耐药细胞系SKOV3-CB较其亲本SKOV3细胞系差异表达下调的肿瘤抑制基因,并验证其差异表达.方法 应用分子生物信息学方法,分析基因芯片中卵巢癌SKOV3-CB细胞系较SKOV3细胞系差异表达下调两倍以上的基因1554条,筛选出肿瘤抑制基因17个,即:RNASET2,VHL,DLG1,COPS2,NOL7,GGNBP2,RBL1,S100A2, PARG1,PERP,TCF3,DNAJA3,PCGF2,ING1,CYLD,RARRES3,RBBP8,应用荧光定量PCR技术对差异表达进行验证.结果 RNASET2,VHL,DLG1,COPS2,NOL7,RBL1,S100A2,PARG1, PERP,TCF3,DNAJA3,ING1,CYLD,RARRES3,RBBP8基因差异表达下调,下调倍数分别为24.47、65.24、10.81、21.30、72.94、5.95、27.13、1.57、 1.32、12.93、46.80、7.57、14.90、14.00、23.98.GGNBP2,PCGF2,DLG1基因差异表达上调,上调倍数分别为5.76、2.19和17.10,基因芯片差异表达结果与real-time PCR所验证表达下降趋势的结果符合率为82.35