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目的 肺癌是目前我国死亡率最高的恶性肿瘤,发病率和病死率持续升高,且预后较差,患者的5年生存率小于15%,严重威胁人们的健康.筛选肺癌遗传易感差异表达的miRNA,分析差异表达的miRNA的靶基因功能,可为进一步研究miRNA在肺癌发生发展过程中的作用提供实验基础.方法 采用高通量测序技术检测海南地区汉族肺癌患者和对照患者血清中差异表达的miRNA,通过生物信息学方法预测差异miRNAs的靶基因,并对靶基因进行GO功能富集分析、KEGG信号通路分析和蛋白相互作用分析.结果 肺癌患者和对照患者共筛选出3个显著差异表达的miR-NA (P<0.05,log2 (Fold Change)≥1),且均呈下调状态.差异表达miRNAs所预测的靶基因显著参与癌症通路、轴突导向通路、代谢通路,NUFIP2、PLAGL2、IGF1R基因编码的蛋白在互作网络中具有重要作用.结论 海南地区肺癌患者和对照患者间存在3个差异表达的miRNAs,这些miRNAs可能通过调控癌症、轴突导向、代谢等信号通路,调节下游靶蛋白参与肺癌的发生过程.

作者:吕鹏飞;肖莎;周静;马亚萍;李晓珍;黄奕江;龙文芳

来源:中国热带医学 2019 年 19卷 8期

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作者:
吕鹏飞;肖莎;周静;马亚萍;李晓珍;黄奕江;龙文芳
来源:
中国热带医学 2019 年 19卷 8期
标签:
miRNA 肺癌 生物信息学 高通量测序技术
目的 肺癌是目前我国死亡率最高的恶性肿瘤,发病率和病死率持续升高,且预后较差,患者的5年生存率小于15%,严重威胁人们的健康.筛选肺癌遗传易感差异表达的miRNA,分析差异表达的miRNA的靶基因功能,可为进一步研究miRNA在肺癌发生发展过程中的作用提供实验基础.方法 采用高通量测序技术检测海南地区汉族肺癌患者和对照患者血清中差异表达的miRNA,通过生物信息学方法预测差异miRNAs的靶基因,并对靶基因进行GO功能富集分析、KEGG信号通路分析和蛋白相互作用分析.结果 肺癌患者和对照患者共筛选出3个显著差异表达的miR-NA (P<0.05,log2 (Fold Change)≥1),且均呈下调状态.差异表达miRNAs所预测的靶基因显著参与癌症通路、轴突导向通路、代谢通路,NUFIP2、PLAGL2、IGF1R基因编码的蛋白在互作网络中具有重要作用.结论 海南地区肺癌患者和对照患者间存在3个差异表达的miRNAs,这些miRNAs可能通过调控癌症、轴突导向、代谢等信号通路,调节下游靶蛋白参与肺癌的发生过程.