目的 评价不同串联重复序列(VNTR)位点组合在北京地区北京基因型结核分枝杆菌基因分型中的应用.方法 采用多位点数目可变串联重复序列分析(MLVA)技术对72株北京地区北京基因型菌株的24个VNTR位点进行分析,基因多态性分析采用BioNumerics软件.结果 24个位点的多态性差异较大,位点QUB-11b (HGI 0.651)、 Mtub 21 (HGI 0.556)和QUB-26 (HGI 0.518)的多态性较高,有两个位点(MIRU 2和MIRU 24)则不具有多态性;不同VNTR位点组合(12位点,15位点,24位点)在北京基因型菌株中的分辨指数依次升高,分别为0.788,0.990,0.992,后两个组合的差异仅是由位点Mtub 29引起的.结论 不同的VNTR位点在北京地区北京基因型菌株中的分辨力存在差异;推荐的基础VNTR 15位点与Mtub 29组合可作为北京地区结核分枝杆菌分子流行病学研究的一线方法.
作者:李墨;焦伟伟;孙桂芝;Igor Mokrousov;郭雅洁;申阿东
来源:中国人兽共患病学报 2008 年 24卷 6期