目的:探讨福州市性病门诊人群泌尿生殖道沙眼衣原体的基因型分布状况。方法收集2013-2014年临床疑似生殖道沙眼衣原体感染者标本2019份,用实时荧光定量PCR检测沙眼衣原体,阳性标本用套式PCR扩增Omp1区并进行测序分析。测序结果上传至BLAST 网站查找序列的相似性、构建系统树确定基因型。结果检测沙眼衣原体阳性标本86份,成功分型的有83份,1株为混合感染。测得8个基因型,分别为:F型(36.59%)、E型(24.39%)、D型(12.20%)、G型(9.76%)、J型(9.76%)、H型(3.66%)、K型(2.44%)、B型(1.22%)。计算不同基因型间Omp1基因的核苷酸的同义突变率(dS )和非同义突变率(dN ),发现仅G型的dN/dS值大于1,其他型均小于1。结论 F型和E型是福州市性病门诊人群泌尿生殖道沙眼衣原体的主要基因型。同义替代是O m p1基因在进化过程中的主要变异。
作者:萧剑雄;王惠榕
来源:中国人兽共患病学报 2015 年 10期