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目的 从不同病情手足口病(HFMD)患儿中分离鉴定人肠道病毒71型(HEV71)并分析其VP1基因型及药物结合位点突变情况.方法 从2014年浙江省绍兴地区轻、重症各4例HFMD患儿标本中分离HEV71并用RT-PCR进行鉴定.采用RT-PCR扩增病毒分离株全长VP1基因并测序.采用专业生物信息学软件,对HEV71分离株进行VP1基因分型、确定VP1基因中药物结合位点突变情况及构建HEV71分离株系统进化树.结果 8例HFMD患儿标本中均分离出HEV71.HEV71分离株与文献报道的VP1-C4a基因亚型的核苷酸和氨基酸序列相似性分别高达97.2%~98.8%和99.3%~99.7%.2例重症患儿HEV71分离株分别在VP1基因序列第179位药物结合位点发生V179L点突变.5株HEV71与安徽和湖南分离株、3株与上海和山东分离株亲缘关系较近.结论 本地区不同病情HFMD患儿分离的HEV71均为VP1-C4a基因亚型,重症患儿HEV71分离株VP1基因第179位药物结合位点突变可能与病情严重程度有关.

作者:蒋卓婧;何婷婷;陈金堃;严杰

来源:中国人兽共患病学报 2016 年 32卷 5期

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蒋卓婧;何婷婷;陈金堃;严杰
来源:
中国人兽共患病学报 2016 年 32卷 5期
标签:
手足口病 人肠道病毒71型 VP1基因 基因分型 药物结合位点/突变 hand-foot-mouth disease/HFMD human enterovirus 71/ HEV71 VP1 gene genotyping drug-binding site/mutation
目的 从不同病情手足口病(HFMD)患儿中分离鉴定人肠道病毒71型(HEV71)并分析其VP1基因型及药物结合位点突变情况.方法 从2014年浙江省绍兴地区轻、重症各4例HFMD患儿标本中分离HEV71并用RT-PCR进行鉴定.采用RT-PCR扩增病毒分离株全长VP1基因并测序.采用专业生物信息学软件,对HEV71分离株进行VP1基因分型、确定VP1基因中药物结合位点突变情况及构建HEV71分离株系统进化树.结果 8例HFMD患儿标本中均分离出HEV71.HEV71分离株与文献报道的VP1-C4a基因亚型的核苷酸和氨基酸序列相似性分别高达97.2%~98.8%和99.3%~99.7%.2例重症患儿HEV71分离株分别在VP1基因序列第179位药物结合位点发生V179L点突变.5株HEV71与安徽和湖南分离株、3株与上海和山东分离株亲缘关系较近.结论 本地区不同病情HFMD患儿分离的HEV71均为VP1-C4a基因亚型,重症患儿HEV71分离株VP1基因第179位药物结合位点突变可能与病情严重程度有关.