目的 通过生物信息学方法分析结肠癌(colorectal cancer,CRC)相关的基因,构建其蛋白质相互作用网络,并预测结肠癌的microRNA、转录因子和相关药物.方法 首先通过倍数关系值分析255个结肠癌相关的微阵列芯片样本中的表达基因,然后使用蛋白质网络数据库String构建其蛋白质相互作用网络,最后应用MSigDB 3.0分析法并结合WebGestalt在线软件,对3组数据中的表达基因进行microRNA、转录因子和药物预测.结果 本研究识别了4763个与结肠癌有关的基因,并采用表达最显著的前200个基因构建了蛋白质相互作用网络.此外,本文又采用前200个基因,通过生物信息学方法预测得到了与结肠癌有关的22条microRNA、58个转录因子和9种药物.结论 本研究识别了结肠癌的表达基因,构建了其蛋白质相互作用网络,并预测了其microRNA、转录因子和结肠癌有关药物,为结肠癌的诊断和治疗提供了潜在的生物标记.
作者：邵学谦；孙雯
来源：中国生化药物杂志 2014 年 8期
