目的 基于副溶血性弧菌tdh1 DNA序列中特异性变异位点,建立新的大流行株鉴别方法.方法 通过对多种型别菌株的tdh序列进行比对,查找大流行株特异性变异位点,并基于该位点设计位点特异性PCR体系和检测方法.以GS-PCR和tdh基因联合检测为参照方法,用已知大流行株、非大流行株和2014年收集的1 067株副溶血性弧菌对新方法进行验证.结果 3株菌株的6条tdh全序列存在26个多态性位点,其中tdh1基因的第368位碱基的变异[G/A]能用于鉴别大流行株,本研究基于此位点建立了tdh1_368位点特异性PCR.该变异能将1996年后的大流行O3∶K6型菌株与1996前的进行区分,也能将大流行株其他血清型变种与非流行菌株进行区分.对2014年的1067株菌株的检测结果显示,tdh1_368位点特异性PCR与参考方法检测结果完全一致.结论 本研究以副溶血性弧菌tdh基因的多态性位点建立检测大流行菌型的试验方法,从对1067株菌株的实测结果来看,tdh1_368位点特异性PCR与既往报道的方法具有高度的一致性,且指标更为直接.
作者:陈洪友;屠丽红;宋元君;陈敏;张曦
来源:中国食品卫生杂志 2015 年 27卷 4期