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目的 应用Logistic回归与多因子降维法(multifactor dimensionality reduction,MDR)分析胃癌易感基因多态性,为胃癌的早期诊断和预警奠定基础.方法 采用病例-对照研究,以中国西北476例汉族胃癌患者为病例组,361名非肿瘤、非消化系统疾病个体为对照组;通过候选基因策略,应用MassARRAY质谱平台分析与代谢、炎症相关的18个基因的37个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点;利用Logistic回归与MDR对基因分型结果进行分析.结果 Logistic回归分析显示,磷脂酶Cε1 (phospholipase C epsilon 1,PLCE1)_rs3765524[OR=1.341,95% CI(1.003,1.792)]、还原型辅酶Ⅰ/Ⅱ醌氧化还原酶1[NAD(P)H:quinone oxidoreductase 1,NQO1]_rs1800566[OR=0.615,95% CI (0.418,0.903)]、X线修复交叉互补基因1(X ray repair cross complementing gene 1,XRCC1)_rs25487 [OR=0.688,95% CI (0.490,0.967)]3个SNP位点的基因型分布与胃癌易感性显著相关(P<0.05);MDR分析显示,PSCA _rs 10216533-XRCC1_rs25487[模型Ⅰ:OR=3.566,95%CI(2.614,4.863)]、MTHF_rs1801131-PSCA _rs2976392-CYP17A1rs6163-CYP19A1_rs4646-CYP19A1 _rs1902586-MMP2_rs243865[模型Ⅱ:OR=7.257,95% CI(5.337,9.870)]、IL1B_rs16944-PSCA_rs102

作者:张文涛;梁平;代鹏;王伟华;汪钦;孙建斌;王伟;颜真

来源:中国生物制品学杂志 2014 年 27卷 5期

知识库介绍

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作者:
张文涛;梁平;代鹏;王伟华;汪钦;孙建斌;王伟;颜真
来源:
中国生物制品学杂志 2014 年 27卷 5期
标签:
胃癌 单核苷酸多态性Logistic回归 多因子降维法 Gastric cancer Single nucleotide polymorphism (SNP) Logistic regression Multifactor dimensionality reduction (MDR)
目的 应用Logistic回归与多因子降维法(multifactor dimensionality reduction,MDR)分析胃癌易感基因多态性,为胃癌的早期诊断和预警奠定基础.方法 采用病例-对照研究,以中国西北476例汉族胃癌患者为病例组,361名非肿瘤、非消化系统疾病个体为对照组;通过候选基因策略,应用MassARRAY质谱平台分析与代谢、炎症相关的18个基因的37个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点;利用Logistic回归与MDR对基因分型结果进行分析.结果 Logistic回归分析显示,磷脂酶Cε1 (phospholipase C epsilon 1,PLCE1)_rs3765524[OR=1.341,95% CI(1.003,1.792)]、还原型辅酶Ⅰ/Ⅱ醌氧化还原酶1[NAD(P)H:quinone oxidoreductase 1,NQO1]_rs1800566[OR=0.615,95% CI (0.418,0.903)]、X线修复交叉互补基因1(X ray repair cross complementing gene 1,XRCC1)_rs25487 [OR=0.688,95% CI (0.490,0.967)]3个SNP位点的基因型分布与胃癌易感性显著相关(P<0.05);MDR分析显示,PSCA _rs 10216533-XRCC1_rs25487[模型Ⅰ:OR=3.566,95%CI(2.614,4.863)]、MTHF_rs1801131-PSCA _rs2976392-CYP17A1rs6163-CYP19A1_rs4646-CYP19A1 _rs1902586-MMP2_rs243865[模型Ⅱ:OR=7.257,95% CI(5.337,9.870)]、IL1B_rs16944-PSCA_rs102