目的 对2019年云南省手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)患者粪便中分离获得的柯萨奇病毒A组4型(coxsackievirus A4,CV-A4)毒株的VP1基因遗传特征进行分析.方法 利用人横纹肌肉瘤RD细胞、人胚肺二倍体KMB-17细胞和非洲绿猴肾Vero细胞分离病毒,以病毒RNA作为逆转录-聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)的模板,扩增病毒完整VP1基因,利用MEGA 6.06和Geneious 9.0.2等软件对VP1序列进行分析.结果 选取8株CV-A4分离株进行分析,其完整VP1序列为915 bp,编码305个氨基酸.8株CV-A4云南分离株与CVA4/High Point/USA/1949/AF081295(简称原型株)的核苷酸一致性和氨基酸同源性分别为83.4%~84.6%和97.0%~98.0%;与其他国内CV-A4参考株相比,核苷酸一致性和氨基酸同源性分别为87.7%~97.0%和97.7%~99.3%.8株CV-A4云南分离株相互比对,核苷酸一致性和氨基酸同源性分别为91.0%~99.9%和97.7%~100.0%.CV-A4云南分离株与大部分中国分离株同属C2基因亚型.结论 本研究中CV-A4分离株均是中国大陆地区优势流行株.
作者:丛山日;刘红波;许丹菡;张名;冯昌增;黄小琴;孙浩;杨昭庆;马绍辉
来源:中国生物制品学杂志 2022 年 35卷 2期