目的 分析中国无偿献血者宏基因组学及微生物组学,评估新发病原体对输血安全的潜在威胁.方法 收集2012~2018年重庆市、广西壮族自治区柳州市、新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市、四川省绵阳市、湖北省武汉市、江苏省南京市、黑龙江省牡丹江市以及云南省德宏傣族景颇族自治州8个地区血站无偿献血者血浆标本12 300(人)份(10 mL/份),以160份血样(0.1 mL/份)混合为1个单位做超速离心(32 000 r/min,离心半径91.9mm)后,用离心柱吸附法提取总DNA,构建文库并应用illumina Hiseq 4500做深度(二代、高通量)测序;通过与细菌、真菌、寄生虫和病毒的参考序列做序列对比,分析宏基因组数据,鉴定样本微生物的分类阶元,评估分析具有潜在危害的病原体.结果 深度测序共获得clean data 632 GB,排在前3位的病原体为假单胞菌属细菌(0.561 1%)、伯克霍尔德菌属细菌(0.468 7%)及沙雷氏菌属细菌(4.242 0%);可通过输血或血制品传播、具有潜在威胁的病原体则有人细小病毒B19(0.126 6%)、利什曼原虫(1.348 5%)、刚地弓形虫(0.615 8%)等.结论 对部分中国无偿献血人群的宏基因组学的分析,可揭示对于我国血液安全造成潜在危害的的病原体,并有针对性地开展新发传染病防控.
作者:李昱辉;高瞻;李世林;李玉佳;黄杨;陈利民;黄梅;万建华;何伟兰;毛伟;蔡杰;周静宇;杨茹;尹以靖;郭艳丽;何苗
来源:中国输血杂志 2021 年 34卷 5期