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目的 开发诸氏鲻虾虎鱼(Mugilogobius chulae)多态性微卫星标记,为诸氏鲻虾虎鱼的遗传背景评价提供基础数据.方法 采用磁珠富集法,以生物素标记的(AC)15为探针,构建了诸氏鲻虾虎鱼微卫星富集文库.经克隆、筛选、测序后,设计合成微卫星引物,利用野生群体对微卫星引物进行多态性筛选和评价.结果 共获得74个含有微卫星重复单元的序列,根据微卫星序列共设计出 33对微卫星引物.利用30个野生诸氏鲻虾虎鱼样本对33对引物的微卫星位点进行了评价,其中有12个位点表现出多态性,平均有效等位基因数(Ne)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)及多态信息含量(PIC)分别为2.9167、2.2311、0.4583、0.5633和0.4474.结论 所筛选的微卫星标记将为诸氏鲻虾虎鱼遗传质量控制及监测提供实验依据.

作者:蔡磊;陈小曲;郑伟强;李建军

来源:中国实验动物学报 2015 年 23卷 1期

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作者:
蔡磊;陈小曲;郑伟强;李建军
来源:
中国实验动物学报 2015 年 23卷 1期
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诸氏鲻虾虎鱼 多态性 微卫星标记 遗传多样性 Mugilogobius chulae Polymorphism Microsatellites Genetic diversity
目的 开发诸氏鲻虾虎鱼(Mugilogobius chulae)多态性微卫星标记,为诸氏鲻虾虎鱼的遗传背景评价提供基础数据.方法 采用磁珠富集法,以生物素标记的(AC)15为探针,构建了诸氏鲻虾虎鱼微卫星富集文库.经克隆、筛选、测序后,设计合成微卫星引物,利用野生群体对微卫星引物进行多态性筛选和评价.结果 共获得74个含有微卫星重复单元的序列,根据微卫星序列共设计出 33对微卫星引物.利用30个野生诸氏鲻虾虎鱼样本对33对引物的微卫星位点进行了评价,其中有12个位点表现出多态性,平均有效等位基因数(Ne)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)及多态信息含量(PIC)分别为2.9167、2.2311、0.4583、0.5633和0.4474.结论 所筛选的微卫星标记将为诸氏鲻虾虎鱼遗传质量控制及监测提供实验依据.