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目的 探讨子宫内膜异位症不同分期患者子宫内膜组织异常基因表达情况,并挖掘最相关细胞死亡途径.方法 检索美国国立生物技术信息中心(NCBI)的GEO(Gene Expression Omnibus)数据库子宫内膜异位症患者子宫内膜组织表达谱芯片,通过GEO2R工具筛选差异基因,并利用DAVID数据库进行生物学过程通路富集分析,将差异基因与GeneCards检索得到的五种细胞死亡相关基因交集分析,以判别最高相关性的细胞死亡方式.结果 最终纳入一项子宫内膜异位症患者子宫内膜组织表达谱芯片数据,共涉及111例子宫内膜组织样本.筛选出子宫内膜异位症疾病相关异常表达基因431个(|logFC|>2.5,调整后P值<0.05),在RNA聚合酶II启动子转录的正调控、细胞增殖、细胞分裂、凋亡过程正调控和细胞内信号转导等60条通路显著富集(P<0.05).IFI6等14种基因在微轻度与中重度子宫内膜异位症患者内膜组织存在显著表达差异(调整后P值<0.05).在五种细胞死亡方式中,凋亡与子宫内膜异位症患者子宫内膜组织细胞最为相关,共有1058个交集基因.结论 子宫内膜异位症患者子宫内膜组织基因表达存在显著异常,与凋亡相关基因关联密切,不同分期的子宫内膜异位症患者也许能够通过子宫内膜组织基因表达差异进行区分.

作者:赵一鸣;倪喆鑫;刘新敏

来源:中国生育健康杂志 2022 年 33卷 4期

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赵一鸣;倪喆鑫;刘新敏
来源:
中国生育健康杂志 2022 年 33卷 4期
标签:
子宫内膜异位症 在位子宫内膜 基因表达 细胞死亡方式
目的 探讨子宫内膜异位症不同分期患者子宫内膜组织异常基因表达情况,并挖掘最相关细胞死亡途径.方法 检索美国国立生物技术信息中心(NCBI)的GEO(Gene Expression Omnibus)数据库子宫内膜异位症患者子宫内膜组织表达谱芯片,通过GEO2R工具筛选差异基因,并利用DAVID数据库进行生物学过程通路富集分析,将差异基因与GeneCards检索得到的五种细胞死亡相关基因交集分析,以判别最高相关性的细胞死亡方式.结果 最终纳入一项子宫内膜异位症患者子宫内膜组织表达谱芯片数据,共涉及111例子宫内膜组织样本.筛选出子宫内膜异位症疾病相关异常表达基因431个(|logFC|>2.5,调整后P值<0.05),在RNA聚合酶II启动子转录的正调控、细胞增殖、细胞分裂、凋亡过程正调控和细胞内信号转导等60条通路显著富集(P<0.05).IFI6等14种基因在微轻度与中重度子宫内膜异位症患者内膜组织存在显著表达差异(调整后P值<0.05).在五种细胞死亡方式中,凋亡与子宫内膜异位症患者子宫内膜组织细胞最为相关,共有1058个交集基因.结论 子宫内膜异位症患者子宫内膜组织基因表达存在显著异常,与凋亡相关基因关联密切,不同分期的子宫内膜异位症患者也许能够通过子宫内膜组织基因表达差异进行区分.