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目的:在转染效率极低的血液肿瘤细胞株中探索敲除microRNA基因的有效方法,以方便microRNA基因在血液肿瘤疾病中功能的研究.方法:应用转录激活因子样效应蛋白核酸酶(Transcription activator-like effector nuclease,TALEN)介导的基因工程技术敲除人类弥漫大B细胞淋巴瘤OCI-Ly3细胞中的microRNA-21(miR-21)基因,然后通过流式细胞仪富集eGFP+表达细胞、PCR筛选和microRNA定量检测,筛选并建立不表达miR-21的OCI-Ly3单细胞克隆.最后,对不表达mi R-21的OCI-Ly3单细胞克隆进行miR-21基因测序.结果:通过两轮的电转染和筛选实验,获得了4个几乎不表达miR-21的OCI-Ly3单细胞克隆,突变率约为实验起始细胞数的十万分之一.对突变克隆的测序结果显示,多种miR-21序列缺失或插入均可能导致该基因表达显著下调.结论:本方法可以推广、应用于在转染效率极低的血液肿瘤细胞株中敲除任何感兴趣的microRNA基因.

作者:陈步远;胡建达;林仁章;陈鑫基

来源:中国实验血液学杂志 2016 年 24卷 2期

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作者:
陈步远;胡建达;林仁章;陈鑫基
来源:
中国实验血液学杂志 2016 年 24卷 2期
标签:
转录激活因子样效应蛋白核酸酶 弥漫大B细胞淋巴瘤 OCI-Ly3 microRNA-21 transcription activator-like effector nuclease diffuse large B cell lymphoma OCI-Ly3 microRNA-21
目的:在转染效率极低的血液肿瘤细胞株中探索敲除microRNA基因的有效方法,以方便microRNA基因在血液肿瘤疾病中功能的研究.方法:应用转录激活因子样效应蛋白核酸酶(Transcription activator-like effector nuclease,TALEN)介导的基因工程技术敲除人类弥漫大B细胞淋巴瘤OCI-Ly3细胞中的microRNA-21(miR-21)基因,然后通过流式细胞仪富集eGFP+表达细胞、PCR筛选和microRNA定量检测,筛选并建立不表达miR-21的OCI-Ly3单细胞克隆.最后,对不表达mi R-21的OCI-Ly3单细胞克隆进行miR-21基因测序.结果:通过两轮的电转染和筛选实验,获得了4个几乎不表达miR-21的OCI-Ly3单细胞克隆,突变率约为实验起始细胞数的十万分之一.对突变克隆的测序结果显示,多种miR-21序列缺失或插入均可能导致该基因表达显著下调.结论:本方法可以推广、应用于在转染效率极低的血液肿瘤细胞株中敲除任何感兴趣的microRNA基因.