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目的:确认PCR-序列特异性寡核苷酸探针(SSOP)法检出的4例磁珠探针HLA基因分型结果格局异常和3例模棱两可结果样本的HLA真实基因型.方法:对HLA高分辨组织配型血样采用PCR-SSOP法检出的4例磁珠探针HLA基因分型结果格局异常和3例模棱两可结果进一步采用PCR-直接测序分型(SBT)技术和二代测序(NGS)技术复检确认.结果:采用PCR-SSOP方法检出4例磁珠探针HLA基因分型结果格局异常的样本,加做SBT及NGS两种方法复检后结果显示,样本1的HLA-A分型结果与已知基因型不完全匹配,NGS分析显示,该等位基因与同源性最接近的等位基因A*31∶01∶02∶01在第2外显子154位G>A变异,导致28位编码氨基酸由缬氨酸变为蛋氨酸(p.Val28Met),样本 2 的 HLA-C 结果为 C*03∶119,06∶02,样本 3 的 HLA-C 结果为 C*03∶03,07∶137,样本 4 的 HLA-B 结果为 B*55∶02,55∶12.采用PCR-SSOP方法检出3例模棱两可结果样本,加做SBT及NGS两种方法复检后结果显示,样本5的HLA-B结果为 B*15∶58,38∶02,样本 6 的 HLA-DRB1 结果为 DRB1*04∶05,14∶101,样本7 的 HLA-DQB1 结果为 DQB1*03∶34,05∶02.其中等位基因C*03∶119、C*07∶137和DRB1*14∶101均未收录于中国造血干细胞捐献者资料库的常见及确认等位基因(CWD)表2.4版本.结论:PCR-SSOP法磁珠探针HLA

作者:钟显信;巫望达;全湛柔;高素青

来源:中国实验血液学杂志 2023 年 31卷 1期

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作者:
钟显信;巫望达;全湛柔;高素青
来源:
中国实验血液学杂志 2023 年 31卷 1期
标签:
HLA 等位基因 PCR-序列特异性寡核苷酸探针 PCR-直接测序分型 二代测序 HLA allele PCR sequence-specific oligonudeotide probe PCR sequence-based typing next generation sequencing
目的:确认PCR-序列特异性寡核苷酸探针(SSOP)法检出的4例磁珠探针HLA基因分型结果格局异常和3例模棱两可结果样本的HLA真实基因型.方法:对HLA高分辨组织配型血样采用PCR-SSOP法检出的4例磁珠探针HLA基因分型结果格局异常和3例模棱两可结果进一步采用PCR-直接测序分型(SBT)技术和二代测序(NGS)技术复检确认.结果:采用PCR-SSOP方法检出4例磁珠探针HLA基因分型结果格局异常的样本,加做SBT及NGS两种方法复检后结果显示,样本1的HLA-A分型结果与已知基因型不完全匹配,NGS分析显示,该等位基因与同源性最接近的等位基因A*31∶01∶02∶01在第2外显子154位G>A变异,导致28位编码氨基酸由缬氨酸变为蛋氨酸(p.Val28Met),样本 2 的 HLA-C 结果为 C*03∶119,06∶02,样本 3 的 HLA-C 结果为 C*03∶03,07∶137,样本 4 的 HLA-B 结果为 B*55∶02,55∶12.采用PCR-SSOP方法检出3例模棱两可结果样本,加做SBT及NGS两种方法复检后结果显示,样本5的HLA-B结果为 B*15∶58,38∶02,样本 6 的 HLA-DRB1 结果为 DRB1*04∶05,14∶101,样本7 的 HLA-DQB1 结果为 DQB1*03∶34,05∶02.其中等位基因C*03∶119、C*07∶137和DRB1*14∶101均未收录于中国造血干细胞捐献者资料库的常见及确认等位基因(CWD)表2.4版本.结论:PCR-SSOP法磁珠探针HLA