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目的 探索不同培养基、不同培养时间和不同蛋白质提取方法对侵袭性丝状真菌质谱鉴定准确率的影响,旨在提高基质辅助激光解析电离飞行时间质谱技术鉴定侵袭性丝状真菌的准确率.方法 采用分子生物学方法为金标准,同时运用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱技术对所收集临床丝状真菌进行鉴定.根据分子生物学的鉴定结果,去除VITEK-MSv3.0数据库中没有的菌株,其余菌株接种在沙氏葡萄糖琼脂(SDA)、马铃薯葡萄糖琼脂(PDA)和察氏培养基(CA)3种不同的培养基中,采用2种不同的蛋白质提取方法(甲酸乙腈法和磁珠法),获得了不同培养时间点(2、3、5、7和9 d)的特异性质谱指纹图谱.结果 不同丝状真菌蛋白质提取方法进行比较,甲酸乙腈法总鉴定准确率为79.8%,磁珠法总鉴定准确率为77.5%,2种丝状真菌蛋白质提取方法的质谱鉴定准确率差异无统计学意义(x2=1.040,P=0.308).不同培养基进行比较,SDA培养基总鉴定准确率为90.7%,PDA培养基总鉴定准确率为81.4%,CA培养基总鉴定准确率为67.4%,3种不同培养基的丝状真菌质谱鉴定准确率差异有统计学意义(x2=36.609,P<0.001),其中使用SDA培养基鉴定准确率最高,使用CA培养基鉴定准确率最低(SDA vs PDA,x2=7.748,P=0.005;SDA vs CA,x2=35.131,P<0.001;PDA vs CA,x2=10.994,P=0.001).

作者:宗来斌;吕火烊

来源:中国微生态学杂志 2022 年 34卷 3期

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作者:
宗来斌;吕火烊
来源:
中国微生态学杂志 2022 年 34卷 3期
标签:
丝状真菌 基质辅助激光解析电离飞行时间质谱 鉴定 影响因素
目的 探索不同培养基、不同培养时间和不同蛋白质提取方法对侵袭性丝状真菌质谱鉴定准确率的影响,旨在提高基质辅助激光解析电离飞行时间质谱技术鉴定侵袭性丝状真菌的准确率.方法 采用分子生物学方法为金标准,同时运用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱技术对所收集临床丝状真菌进行鉴定.根据分子生物学的鉴定结果,去除VITEK-MSv3.0数据库中没有的菌株,其余菌株接种在沙氏葡萄糖琼脂(SDA)、马铃薯葡萄糖琼脂(PDA)和察氏培养基(CA)3种不同的培养基中,采用2种不同的蛋白质提取方法(甲酸乙腈法和磁珠法),获得了不同培养时间点(2、3、5、7和9 d)的特异性质谱指纹图谱.结果 不同丝状真菌蛋白质提取方法进行比较,甲酸乙腈法总鉴定准确率为79.8%,磁珠法总鉴定准确率为77.5%,2种丝状真菌蛋白质提取方法的质谱鉴定准确率差异无统计学意义(x2=1.040,P=0.308).不同培养基进行比较,SDA培养基总鉴定准确率为90.7%,PDA培养基总鉴定准确率为81.4%,CA培养基总鉴定准确率为67.4%,3种不同培养基的丝状真菌质谱鉴定准确率差异有统计学意义(x2=36.609,P<0.001),其中使用SDA培养基鉴定准确率最高,使用CA培养基鉴定准确率最低(SDA vs PDA,x2=7.748,P=0.005;SDA vs CA,x2=35.131,P<0.001;PDA vs CA,x2=10.994,P=0.001).