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目的 探索尼洛替尼和伊马替尼对慢性粒细胞白血病(CML)细胞基因表达谱的影响,阐明酪氨酸激酶抑制剂(TKI)抑制白血病的分子机制.方法 从在线基因表达数据库中下载表达谱数据集GSE19567,利用BRB-ArrayTools软件进行质量控制并筛选差异表达基因(DEGs ),然后分别对差异基因进行GO功能富集分析、KEGG通路富集分析、pathway互作网络和基因互作网络分析.结果 共筛选出差异基因519个,其中177个上调表达,342个下调表达.GO富集分析发现DEGs主要涉及小分子代谢、血液凝固、转录调控、细胞增殖与凋亡调控等生物过程,发挥的分子功能集中在蛋白结合、蛋白二聚化、序列特异性DNA结合和ATP结合等.KEGG富集分析发现代谢通路、PI3K-Akt信号通路、Jak-STAT信号通路和HIF-1信号通路等pathway显著富集.网络分析挖掘出的核心基因有SHMT 2、CBS 、CTH 、HK 2,核心pathway包括MAPK信号通路、细胞周期和细胞凋亡等.结论 酪氨酸激酶抑制剂影响了CML细胞代谢通路和信号转导通路的相关基因,通过细胞周期阻滞和诱导凋亡等机制抑制白血病,为白血病的靶向治疗提供了基础.

作者:荆凌华;刘松年;马利敏;杨海平

来源:中国现代医学杂志 2018 年 28卷 19期

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作者:
荆凌华;刘松年;马利敏;杨海平
来源:
中国现代医学杂志 2018 年 28卷 19期
标签:
白血病 酪氨酸激酶抑制剂 尼洛替尼 伊马替尼 细胞凋亡 leukemia tyrosine kinase inhibitor Nilotinib Imatinib apoptosis
目的 探索尼洛替尼和伊马替尼对慢性粒细胞白血病(CML)细胞基因表达谱的影响,阐明酪氨酸激酶抑制剂(TKI)抑制白血病的分子机制.方法 从在线基因表达数据库中下载表达谱数据集GSE19567,利用BRB-ArrayTools软件进行质量控制并筛选差异表达基因(DEGs ),然后分别对差异基因进行GO功能富集分析、KEGG通路富集分析、pathway互作网络和基因互作网络分析.结果 共筛选出差异基因519个,其中177个上调表达,342个下调表达.GO富集分析发现DEGs主要涉及小分子代谢、血液凝固、转录调控、细胞增殖与凋亡调控等生物过程,发挥的分子功能集中在蛋白结合、蛋白二聚化、序列特异性DNA结合和ATP结合等.KEGG富集分析发现代谢通路、PI3K-Akt信号通路、Jak-STAT信号通路和HIF-1信号通路等pathway显著富集.网络分析挖掘出的核心基因有SHMT 2、CBS 、CTH 、HK 2,核心pathway包括MAPK信号通路、细胞周期和细胞凋亡等.结论 酪氨酸激酶抑制剂影响了CML细胞代谢通路和信号转导通路的相关基因,通过细胞周期阻滞和诱导凋亡等机制抑制白血病,为白血病的靶向治疗提供了基础.