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目的:探讨与永久性心房颤动(pAF)发生、发展相关的基因和信号通路,为研究pAF发生的分子机制提供基础.方法:用Agilent 4x44K基因芯片分析pAF患者(n=7例)与窦性心律健康者(n=4例)的左心房组织mRNA,寻找差异表达的基因.以Gene Ontology(GO)和KEGG、Biocarta数据库为基础,分析差异表达基因参与的功能和信号通路.选取差异显著的部分基因应用实时定量-聚合酶链式反应(qRT-PCR)在5例pAF患者与5例窦性心律健康者标本进行验证.结果:表达谱结果显示,共有987个差异表达基因,其中567个基因表达下调,420个基因表达上调.选取9个差异显著的基因在新一组的病例标本上应用qRT-PCR验证,结果显示均有统计学差异,且改变与芯片结果一致.这些基因通过参与左心房组织纤维化、电重构、炎症、细胞应激、代谢调节、转录调节等与pAF的发生密切相关.GO和Pathway分析表明下调的基因主要参与调节代谢,表达上调的基因影响细胞应激反应、免疫应答、血小板活化等过程.结论:通过基因芯片技术发现与pAF发生相关的重要基因,通过影响细胞代谢、炎症、免疫应答、血栓形成等参与左心房的结构、功能重构.

作者:高杰;周建;苏丕雄;刘岩;顾松;张希涛;安向光

来源:中国循环杂志 2017 年 32卷 11期

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作者:
高杰;周建;苏丕雄;刘岩;顾松;张希涛;安向光
来源:
中国循环杂志 2017 年 32卷 11期
标签:
心房颤动 基因表达谱 Atrial fibrillation Gene expression profile
目的:探讨与永久性心房颤动(pAF)发生、发展相关的基因和信号通路,为研究pAF发生的分子机制提供基础.方法:用Agilent 4x44K基因芯片分析pAF患者(n=7例)与窦性心律健康者(n=4例)的左心房组织mRNA,寻找差异表达的基因.以Gene Ontology(GO)和KEGG、Biocarta数据库为基础,分析差异表达基因参与的功能和信号通路.选取差异显著的部分基因应用实时定量-聚合酶链式反应(qRT-PCR)在5例pAF患者与5例窦性心律健康者标本进行验证.结果:表达谱结果显示,共有987个差异表达基因,其中567个基因表达下调,420个基因表达上调.选取9个差异显著的基因在新一组的病例标本上应用qRT-PCR验证,结果显示均有统计学差异,且改变与芯片结果一致.这些基因通过参与左心房组织纤维化、电重构、炎症、细胞应激、代谢调节、转录调节等与pAF的发生密切相关.GO和Pathway分析表明下调的基因主要参与调节代谢,表达上调的基因影响细胞应激反应、免疫应答、血小板活化等过程.结论:通过基因芯片技术发现与pAF发生相关的重要基因,通过影响细胞代谢、炎症、免疫应答、血栓形成等参与左心房的结构、功能重构.