目的 :筛选肺动脉高压发生的关键基因,推断与肺动脉高压相关的一些微小RNA(microRNA)功能,为进一步探索肺动脉高压可能的潜在调控靶点提供理论依据.方法:从基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)下载3个人肺组织来源的基因芯片,应用R语言和GEO2R筛选肺动脉高压患者与正常人肺组织中差异表达基因和差异表达microRNA,并通过DAVID 6.8数据库进行基因功能分析和信号通路富集分析,STRING在线数据库构建蛋白之间相互作用可视化网络图(PPI),TargetScan数据库预测差异microRNA靶基因,Cytoscape 3.6.1软件构建microRNA-mRNA网络.结果:获得226个差异基因,这些差异基因主要涉及细胞趋化、炎症反应等生物学过程,主要参与造血细胞系、性别等方面的信号通路,从PPI中识别出10个关键基因HGF、KIT、VCAM1、CXCL12、ITGAM、FPR1、CXCL9、CXCR1、TLR8、CXCR2;获得29个差异microRNA,构建了microRNA-mRNA网络,并从网络中识别出5个关键microRNA.结论:本研究利用GEO数据库筛选出可能参与肺动脉高压发生的关键基因和关键microRNA,为肺动脉高压的研究和治疗提供了新视角.
作者：仲红艳；唐珊；赵飞飞；王大新
来源：中国循环杂志 2020 年 35卷 8期
