目的:建立一种基于蛋白重复序列及线性B细胞表位预测筛选间日疟原虫(Plasmodium vivax,P. vivax)特异性抗原肽的方法。方法以PlasmoDB数据为基础,建立间日疟原虫蛋白序列数据库。编写重复序列查找软件,逐一检索16 aa多肽在全部蛋白序列中的重复次数,统计出重复较高者进行连续B细胞表位预测,优选具有间日疟原虫特异性的肽进行合成,偶联钥孔戚血蓝蛋白(Keyhole limpet hemocyanin,KLH)后免疫小鼠,并检测抗体滴度。结果通过软件分析间日疟原虫全部5432个蛋白序列中的16肽的重复次数,利用BcePred网站预测其中重复较高的1000个序列,获得22个候选肽,经聚类分析和相似性比较,优选到5个潜在特异性肽,人工合成并偶联KLH后免疫小鼠诱生的抗体滴度均超过1:9000。结论建立了一种基于蛋白重复序列联合线性B细胞表位预测筛选间日疟原虫特异性抗原肽的方法,得到的5个肽均能诱导小鼠产生高滴度抗体。
作者:陶志勇;徐岁;王媛媛;方强;夏惠;高琪
来源:中国血吸虫病防治杂志 2014 年 3期