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目的:采用分子对接和分子动力学方法进行盐皮质激素受体拮抗剂(mineralocorticoid receptor antagonists,MRAs)的虚拟筛选,以期发现全新结构的具有潜在治疗糖尿病肾病的先导化合物.方法:收集已知活性的MRAs及其诱饵分子,构建基于结构的盐皮质激素受体虚拟筛选模型,利用该模型对中药成分数据库(Traditional Chinese Medicines Integrated Database,TCMID)进行虚拟筛选,综合对接得分和结合模式挑选2个与阳性药类似的中药成分进行分子动力学模拟,以期发现潜在MRAs.结果:诱饵分子结果表明构建的虚拟筛选模型可用于MRAs化合物库的虚拟筛选,通过对中药成分数据库的虚拟筛选发现30个候选MRAs化合物,其中分子动力学模拟结果表明,水飞蓟莫林的结合自由能略差于已知阳性化合物,可作为MRAs的先导化合物.结论:分子对接结合分子动力学模拟方法可用于从中药成分中筛选新型盐皮质激素受体拮抗剂,为糖尿病肾病药物开发的相关实验研究提供设计思路.

作者:王颖颖;刘巍;孟凡翠;汤立达

来源:中国新药杂志 2020 年 29卷 6期

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作者:
王颖颖;刘巍;孟凡翠;汤立达
来源:
中国新药杂志 2020 年 29卷 6期
标签:
盐皮质激素受体 拮抗剂 分子对接 分子动力学 虚拟筛选
目的:采用分子对接和分子动力学方法进行盐皮质激素受体拮抗剂(mineralocorticoid receptor antagonists,MRAs)的虚拟筛选,以期发现全新结构的具有潜在治疗糖尿病肾病的先导化合物.方法:收集已知活性的MRAs及其诱饵分子,构建基于结构的盐皮质激素受体虚拟筛选模型,利用该模型对中药成分数据库(Traditional Chinese Medicines Integrated Database,TCMID)进行虚拟筛选,综合对接得分和结合模式挑选2个与阳性药类似的中药成分进行分子动力学模拟,以期发现潜在MRAs.结果:诱饵分子结果表明构建的虚拟筛选模型可用于MRAs化合物库的虚拟筛选,通过对中药成分数据库的虚拟筛选发现30个候选MRAs化合物,其中分子动力学模拟结果表明,水飞蓟莫林的结合自由能略差于已知阳性化合物,可作为MRAs的先导化合物.结论:分子对接结合分子动力学模拟方法可用于从中药成分中筛选新型盐皮质激素受体拮抗剂,为糖尿病肾病药物开发的相关实验研究提供设计思路.