目的：虚拟筛选具有组蛋白去乙酰化酶（HDAC）抑制作用的木脂素类化合物。方法：以“木酯素”“Lignanoid”为关键词，查询中国知网、维普、PubMed等中外文数据库中相关文献，收集木脂素类化合物作为配体构建配体库，从蛋白质晶体数据库（PDB）中选取两个HDAC受体HDAC2（PDB code：4LXZ）和HDAC8（PDB code：1T69），运用SYBYL-X 2.0软件将配体和受体三维结构的活性位点进行对接，用总得分来反映配体与受体的亲和力大小。结果：将收集的345个木质素类化合物与4LXZ、1T69原配体一起构建了有347种配体的配体库，其中编号为275、271、110、200、056、258、181、129、037、270、187的配体与HDAC2和HDAC8受体有较好的亲和力，配体与受体的残基以氢键的方式结合。结论：木脂素类化合物具有抑制HDAC的作用；虚拟筛选方法可作为预测天然产物潜在活性的有效手段，为木脂素类化合物新的药理活性研究提供了快捷途径和理论指导。
作者：邸珂；喻欢欢；邹远军；丁锐；钟猛；胥秀英；郑一敏
来源：中国药房 2016 年 4期
