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目的 通过检索肿瘤与癌症基因组图谱(TCGA)及hypoxiaDB数据库中甲状腺癌的相关数据,建立一个基于差异表达的缺氧相关基因模型.方法 比较TCGA数据库和hypoxiaDB数据库中的基因,获得与甲状腺癌缺氧相关的差异表达基因.随后进行基因功能富集分析、构建蛋白质-蛋白质相互作用网络、筛选出具有预后价值的缺氧相关基因来建立并验证预后模型.结果 共发现326个缺氧相关甲状腺癌基因.功能富集分析表明,这些基因主要参与生物功能调节.单因素Cox回归分析结果显示,共有23个基因与甲状腺癌预后相关,其中,11个基因通过多因素Cox分析构建了新的预后模型.结果 显示,高风险评分(P<0.005)的患者总生存期比低风险评分的患者短.对甲状腺癌患者预后价值的单变量分析结果显示,构建的预后模型与患者的总体生存率显著相关.结论 本研究的模型对甲状腺癌的预后有很好的预测作用.

作者:张弘扬;李思嘉;李巍

来源:中国医科大学学报 2022 年 51卷 4期

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作者:
张弘扬;李思嘉;李巍
来源:
中国医科大学学报 2022 年 51卷 4期
标签:
缺氧 甲状腺癌 预后 肿瘤与癌症基因组图谱
目的 通过检索肿瘤与癌症基因组图谱(TCGA)及hypoxiaDB数据库中甲状腺癌的相关数据,建立一个基于差异表达的缺氧相关基因模型.方法 比较TCGA数据库和hypoxiaDB数据库中的基因,获得与甲状腺癌缺氧相关的差异表达基因.随后进行基因功能富集分析、构建蛋白质-蛋白质相互作用网络、筛选出具有预后价值的缺氧相关基因来建立并验证预后模型.结果 共发现326个缺氧相关甲状腺癌基因.功能富集分析表明,这些基因主要参与生物功能调节.单因素Cox回归分析结果显示,共有23个基因与甲状腺癌预后相关,其中,11个基因通过多因素Cox分析构建了新的预后模型.结果 显示,高风险评分(P<0.005)的患者总生存期比低风险评分的患者短.对甲状腺癌患者预后价值的单变量分析结果显示,构建的预后模型与患者的总体生存率显著相关.结论 本研究的模型对甲状腺癌的预后有很好的预测作用.