目的:通过生物信息学手段筛选驱动头颈部鳞癌(HNSCC)进展的潜在关键转录因子,分析其表达特征及预后意义.方法:从癌症基因组图谱数据库获取HNSCC转录组测序数据,筛选不同分期肿瘤组织与正常黏膜组织的差异转录因子.通过STEM工具分析差异转录因子在HNSCC进展过程的表达模式.在R3.5.1环境下,利用survival包和survminer包计算差异转录因子的预后意义.最后利用人类蛋白图谱数据库对候选转录因子进行免疫组化验证,并通过基因集富集分析挖掘与转录因子密切相关的通路.结果:和正常组织相比,HNSCC各分期的差异转录因子分别为172(Ⅰ期),272(Ⅱ期),272(Ⅲ期),307(Ⅳ期),各分期共有差异转录因子为7个.其中HLF及KLF7等5个差异转录因子与HNSCC患者预后显著相关.免疫组化结果显示,上述转录因子表达趋势均与转录组测序结果一致,其中HLF在HNSCC 4个分期表达均显著下调,而KLF7则呈现相反趋势.基因集富集分析显示,HLF表达下调可显著激活细胞外基质分解及对Ⅰ型干扰素的反应等生物进程;KLF7高表达时,角质形成细胞增殖、细胞-基质连接组件等生物进程显著激活.结论:HLF及KLF7等转录因子表达失调与HNSCC分期及患者预后密切相关,并潜在参与驱动HNSCC的恶性进展.
作者：张智颖；潘宗富；郑菁
来源：中国药师 2020 年 23卷 8期
