您的账号已在其他设备登录,您当前账号已强迫下线,
如非您本人操作,建议您在会员中心进行密码修改

确定
收藏 | 浏览154 | 下载10

目的:采用网络药理学研究艾叶干预原发性痛经的潜在靶点和机制.方法:通过中药系统药理数据库及分析平台(TCMSP)筛选有效化合物,经美国国立卫生研究院(NIH)的开放化学数据库(PubChem)和预测分子亲脂性和水溶性程序ALOGPS 2.1确定,并预测艾叶作用靶点;通过DisGeNET、NCBI-Gene、DrugBank和GeneCards数据库收集原发性痛经靶点.通过功能性蛋白关联网络(String)和可视化网络软件(Cytoscaoe3.6)筛选出交集基因中的核心基因以及确定信号通路.结果:通过分子式预测艾叶的化合物作用靶点有442个.此外,4个数据库共收集到351个靶点,这两个靶点集相交集的靶点有66个.通过软件Cytoscape3.6筛选出丝氨酸/苏氨酸激酶(AKT1)、前列腺素-内过氧化物合酶(PTGS2)、血管内皮生长因子(VEGFA)等5个靶标蛋白核心基因,并构建药物-化合物-靶点-疾病网络图.在String数据库中显示艾叶与原发性痛经之间的信号通路有114条,最显著的通路集中在亚油酸代谢(hsa00591)、花生四烯酸代谢(hsa00590)、甾体激素生物合成(hsa00140)和卵巢甾体生成(hsa04913)信号通路.使用分子对接软件Autodock对5个核心靶点与9个化合物之间做分子对接,发现9个化合物中有8个化合物能和5个核心靶点有良好的对接.最后通过三维分子软件PyMOL计算靶点-化合物之间的作用

作者:陈海军;李盛村;姜方琦

来源:中国药师 2021 年 24卷 10期

知识库介绍

临床诊疗知识库该平台旨在解决临床医护人员在学习、工作中对医学信息的需求,方便快速、便捷的获取实用的医学信息,辅助临床决策参考。该库包含疾病、药品、检查、指南规范、病例文献及循证文献等多种丰富权威的临床资源。

详细介绍
热门关注
免责声明:本知识库提供的有关内容等信息仅供学习参考,不代替医生的诊断和医嘱。

收藏
| 浏览:154 | 下载:10
作者:
陈海军;李盛村;姜方琦
来源:
中国药师 2021 年 24卷 10期
标签:
艾叶;原发性痛经;网络药理学;药物-化合物-靶点-疾病;分子对接
目的:采用网络药理学研究艾叶干预原发性痛经的潜在靶点和机制.方法:通过中药系统药理数据库及分析平台(TCMSP)筛选有效化合物,经美国国立卫生研究院(NIH)的开放化学数据库(PubChem)和预测分子亲脂性和水溶性程序ALOGPS 2.1确定,并预测艾叶作用靶点;通过DisGeNET、NCBI-Gene、DrugBank和GeneCards数据库收集原发性痛经靶点.通过功能性蛋白关联网络(String)和可视化网络软件(Cytoscaoe3.6)筛选出交集基因中的核心基因以及确定信号通路.结果:通过分子式预测艾叶的化合物作用靶点有442个.此外,4个数据库共收集到351个靶点,这两个靶点集相交集的靶点有66个.通过软件Cytoscape3.6筛选出丝氨酸/苏氨酸激酶(AKT1)、前列腺素-内过氧化物合酶(PTGS2)、血管内皮生长因子(VEGFA)等5个靶标蛋白核心基因,并构建药物-化合物-靶点-疾病网络图.在String数据库中显示艾叶与原发性痛经之间的信号通路有114条,最显著的通路集中在亚油酸代谢(hsa00591)、花生四烯酸代谢(hsa00590)、甾体激素生物合成(hsa00140)和卵巢甾体生成(hsa04913)信号通路.使用分子对接软件Autodock对5个核心靶点与9个化合物之间做分子对接,发现9个化合物中有8个化合物能和5个核心靶点有良好的对接.最后通过三维分子软件PyMOL计算靶点-化合物之间的作用