目的对北京协和医院分离的SARS冠状病毒(SARS-CoV)PUMC01株的基因组序列进行变异及系统发育分析.方法利用随机引物法构建SARS-CoV-PUMC01分离株的cDNA文库,随机挑选质粒克隆进行大规模测序,测序反应经过组装后获得全基因组序列(Genbank Accession No.,AY350750),对该序列与SARS-CoV的参考序列相比进行系统发育及变异分析.结果与参考序列(SARS-CoV-Tor2及SARS-CoV-Urbani)相比较,在SARS-CoV-PUMC01上共发现10个变异位点;与其他的17株SARS-CoV进行系统发育分析后发现,18株SARS-CoV分为两类,两类之间及每一类的各株病毒间具有不同的分化时间.结论了解不同地区SARS-CoV之间的系统发育关系,为系统了解不同SARS-CoV分离株之间的临床关系以及SARS-CoV的传播链提供了进化上的证据.
作者:邹柯;朱华;丁克越;王仲;刘勇;王婷;杨剑;魏国柱;周鑫峰;张文;于占霞;樊峥;彭晓忠;秦川;刘湘军;沈岩;倪安平;强伯勤
来源:中国医学科学院学报 2003 年 25卷 5期