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目的 探讨长链非编码RNA(lncRNA)ZEB1-AS1对B细胞非霍奇金淋巴瘤(B-cell non-Hodgkin's lymphoma,B-NHL)细胞增殖和凋亡的影响,构建lncRNA、miRNA、mRNA相关竞争性内源RNA(ceRNAs)网络.方法 采用Cox回归模型筛选GEO数据集(GSE31312)中与弥漫大B细胞淋巴瘤(diffuse large B-cell lymphoma,DLBCL)预后相关的lncRNAs.采用慢病毒转染技术建立ZEB1-AS1敲低的B-NHL细胞模型,采用CCK-8法和流式细胞术分别检测敲低ZEB1-AS1及不同浓度(50 ng/mL、100 ng/mL、200 ng/mL、400 ng/mL)多柔比星(doxorubicin,Dox)处理后的细胞增殖与凋亡情况.构建以ZEB1-AS1为节点的lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA调控网络,利用GO、KEGG和PPI分析该调控网络下游相关的核心mRNA及其功能.结果 共筛选了20个高风险lncRNAs.预测与ZEB1-AS1有相互结合的miRNA 4个,与ZEB1-AS1呈共表达关系又与miRNA相结合的潜在下游mRNA 1208个,以此构建lncRNA-miRNA-mRNA调控网络及PPI调控网络.在体外实验中,与空载组相比,敲低ZEB1-AS1可显著抑制细胞增殖和促进细胞凋亡(均P<0.05),敲低ZEB1-AS1+Dox作用对抑制淋巴瘤细胞增殖和促进细胞凋亡有协同作用.结论 ZEB1-AS1敲低可抑制B-NHL细胞增殖和促进细胞凋亡,且可能增强Dox的药物敏感性;以ZEB1-AS1为节点构建的ceRNA调

作者:廖成成;邓木英;莫国君;雷丹青;夏爱军;荣超;谭晓虹;岑洪;卢盛娟

来源:中国癌症防治杂志 2021 年 13卷 2期

知识库介绍

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廖成成;邓木英;莫国君;雷丹青;夏爱军;荣超;谭晓虹;岑洪;卢盛娟
来源:
中国癌症防治杂志 2021 年 13卷 2期
标签:
B细胞非霍奇金淋巴瘤 弥漫大B细胞淋巴瘤 LncRNA ZEB1-AS1 增殖 凋亡 ceRNA网络
目的 探讨长链非编码RNA(lncRNA)ZEB1-AS1对B细胞非霍奇金淋巴瘤(B-cell non-Hodgkin's lymphoma,B-NHL)细胞增殖和凋亡的影响,构建lncRNA、miRNA、mRNA相关竞争性内源RNA(ceRNAs)网络.方法 采用Cox回归模型筛选GEO数据集(GSE31312)中与弥漫大B细胞淋巴瘤(diffuse large B-cell lymphoma,DLBCL)预后相关的lncRNAs.采用慢病毒转染技术建立ZEB1-AS1敲低的B-NHL细胞模型,采用CCK-8法和流式细胞术分别检测敲低ZEB1-AS1及不同浓度(50 ng/mL、100 ng/mL、200 ng/mL、400 ng/mL)多柔比星(doxorubicin,Dox)处理后的细胞增殖与凋亡情况.构建以ZEB1-AS1为节点的lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA调控网络,利用GO、KEGG和PPI分析该调控网络下游相关的核心mRNA及其功能.结果 共筛选了20个高风险lncRNAs.预测与ZEB1-AS1有相互结合的miRNA 4个,与ZEB1-AS1呈共表达关系又与miRNA相结合的潜在下游mRNA 1208个,以此构建lncRNA-miRNA-mRNA调控网络及PPI调控网络.在体外实验中,与空载组相比,敲低ZEB1-AS1可显著抑制细胞增殖和促进细胞凋亡(均P<0.05),敲低ZEB1-AS1+Dox作用对抑制淋巴瘤细胞增殖和促进细胞凋亡有协同作用.结论 ZEB1-AS1敲低可抑制B-NHL细胞增殖和促进细胞凋亡,且可能增强Dox的药物敏感性;以ZEB1-AS1为节点构建的ceRNA调