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目的 探讨红景天治疗急性髓系白血病(AML)的药理作用机制.方法 检索中医药整合药理学研究平台(TCMIP)、本草组鉴平台(HERB)及相关文献,收集红景天的有效成分;利用Swiss TargetPrediction数据库获取各有效成分的潜在作用靶点.利用GeneCards数据库检索AML的疾病相关靶点,将药物与疾病的共有靶点导入String网站,构建共有靶点蛋白相互作用(PPI)网络,并导入Cytoscape 3.8.1 软件使网络可视化,筛选关键靶点.利用DAVID数据库中对共有靶点进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.利用AutoDock Vina软件对核心靶点蛋白与对应药物有效成分进行分子对接,并用PyMOL软件对其结果进行可视化分析.结果 共得到红景天有效成分 160 个及其作用靶点 336 个,AML疾病相关靶点 874 个,共有靶点 81 个.其中有效成分主要包括山柰酚、槲皮素、草质素、柽柳素、毡毛美洲茶素、麦黄酮等,核心靶点主要包括GAPDH,TP53,AKT1,VEGFA,EGFR.GO功能富集分析结果获得生物学过程 209 项,分子功能 56 项,细胞组分 36 项.KEGG通路富集分析结果得到相关信号通路101条,主要涉及癌症通路、PI3K-Akt信号通路等.分子对接结果显示,5个关键靶点与其对应的有效成分亲和力均良好.结论 红景天的有效成分可能通过与核

作者:纪颖慧;丁传华;唐琳琳;刘文山

来源:中国药业 2023 年 32卷 18期

知识库介绍

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纪颖慧;丁传华;唐琳琳;刘文山
来源:
中国药业 2023 年 32卷 18期
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红景天 急性髓系白血病 网络药理学 分子对接 Rhodiolae Crenulatae Radix et Rhizoma acute myeloid leukemia network pharmacology molecular docking
目的 探讨红景天治疗急性髓系白血病(AML)的药理作用机制.方法 检索中医药整合药理学研究平台(TCMIP)、本草组鉴平台(HERB)及相关文献,收集红景天的有效成分;利用Swiss TargetPrediction数据库获取各有效成分的潜在作用靶点.利用GeneCards数据库检索AML的疾病相关靶点,将药物与疾病的共有靶点导入String网站,构建共有靶点蛋白相互作用(PPI)网络,并导入Cytoscape 3.8.1 软件使网络可视化,筛选关键靶点.利用DAVID数据库中对共有靶点进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.利用AutoDock Vina软件对核心靶点蛋白与对应药物有效成分进行分子对接,并用PyMOL软件对其结果进行可视化分析.结果 共得到红景天有效成分 160 个及其作用靶点 336 个,AML疾病相关靶点 874 个,共有靶点 81 个.其中有效成分主要包括山柰酚、槲皮素、草质素、柽柳素、毡毛美洲茶素、麦黄酮等,核心靶点主要包括GAPDH,TP53,AKT1,VEGFA,EGFR.GO功能富集分析结果获得生物学过程 209 项,分子功能 56 项,细胞组分 36 项.KEGG通路富集分析结果得到相关信号通路101条,主要涉及癌症通路、PI3K-Akt信号通路等.分子对接结果显示,5个关键靶点与其对应的有效成分亲和力均良好.结论 红景天的有效成分可能通过与核