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目的:基于网络药理学的方法研究华蟾素注射液治疗结直肠癌的分子机制,并采用分子对接实验进行验证.方法:通过Pubmed,Embase和CNKI数据库筛选华蟾素注射液成分,通过Swiss Target Prediction和STITCH数据库筛选成分靶点;通过TCGA数据库数据,运用R软件进行结直肠癌差异表达基因分析;华蟾素注射液靶基因与结直肠癌差异表达基因取交集后进行GO、KEGG、PPI分析,并运用Cytoscape 3.6软件筛选Hub基因;AutoDock Vina用于分子对接验证.结果:共获得华蟾素注射液23个成分,共筛选413个靶基因;通过生物信息学方法获得TCGA结直肠癌数据差异表达基因5672个;取交集后共获得75个基因.KEGG通路主要富集在"癌性通路"等;Hub基因包括SRC、STAT3、SIRT1、PTGS2、CDK4、PTK2、ITGB1、CDK2、ITGB2和PT-GER4.分子对接实验证实所有Hub基因均与成分存在较低的分子对接能.结论:基于网络药理学和分子对接实验初步证明华蟾素注射液通过多靶点、多途径、多通路在结直肠癌的治疗中发挥重要作用,为临床中华蟾素注射液治疗结直肠癌提供分子机制层面的客观证据.

作者:郑波波;王新;岳育民;王权;王国荣

来源:中国医药导刊 2022 年 24卷 4期

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作者:
郑波波;王新;岳育民;王权;王国荣
来源:
中国医药导刊 2022 年 24卷 4期
标签:
华蟾素注射液 结直肠癌 网络药理学 分子对接
目的:基于网络药理学的方法研究华蟾素注射液治疗结直肠癌的分子机制,并采用分子对接实验进行验证.方法:通过Pubmed,Embase和CNKI数据库筛选华蟾素注射液成分,通过Swiss Target Prediction和STITCH数据库筛选成分靶点;通过TCGA数据库数据,运用R软件进行结直肠癌差异表达基因分析;华蟾素注射液靶基因与结直肠癌差异表达基因取交集后进行GO、KEGG、PPI分析,并运用Cytoscape 3.6软件筛选Hub基因;AutoDock Vina用于分子对接验证.结果:共获得华蟾素注射液23个成分,共筛选413个靶基因;通过生物信息学方法获得TCGA结直肠癌数据差异表达基因5672个;取交集后共获得75个基因.KEGG通路主要富集在"癌性通路"等;Hub基因包括SRC、STAT3、SIRT1、PTGS2、CDK4、PTK2、ITGB1、CDK2、ITGB2和PT-GER4.分子对接实验证实所有Hub基因均与成分存在较低的分子对接能.结论:基于网络药理学和分子对接实验初步证明华蟾素注射液通过多靶点、多途径、多通路在结直肠癌的治疗中发挥重要作用,为临床中华蟾素注射液治疗结直肠癌提供分子机制层面的客观证据.