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目的:基于网络药理学方法,探讨"蒲公英-夏枯草"药对治疗乳腺癌作用机制.方法:利用中药系统药理学数据库和分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)筛选出"蒲公英-夏枯草"药对的主要化学成分及作用靶点,建立"成分-靶点"蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络.利用比较毒理基因组学数据库(comparative toxicogenomics database,CTD)检索与乳腺癌相关的基因,采用Cytoscape 3.6.1软件构建"疾病-靶点"PPI网络.基于Cytoscape 3.6.1软件的Merge功能,合并"成分-靶点"和"疾病-靶点"的PPI网络,筛选出主要核心网络,借助David数据库、Reactome数据库及Omicshare平台,进行基因本体(gene ontology,GO)富集分析、京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析.通过动物实验,验证"蒲公英-夏枯草"药对的抗肿瘤作用机制.结果:筛选得到含383个节点、594条连接的"蒲公英-夏枯草"药对"成分-靶点"PPI网络,含500个靶点的乳腺癌"疾病-靶点"PPI网络.利用网络合并,最终建立了含61个核心靶点的"成分-靶点-疾病"网络.基因GO功能分析结果主要与生物过程和分子功能有关;基因KEGG通路富集分析结果与免疫系统、

作者:唐吉伟;郑叁;曹学帅;张柏银;顾晖;郭亦杰

来源:中国医院用药评价与分析 2020 年 20卷 1期

知识库介绍

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作者:
唐吉伟;郑叁;曹学帅;张柏银;顾晖;郭亦杰
来源:
中国医院用药评价与分析 2020 年 20卷 1期
标签:
蒲公英 夏枯草 乳腺癌 网络药理学
目的:基于网络药理学方法,探讨"蒲公英-夏枯草"药对治疗乳腺癌作用机制.方法:利用中药系统药理学数据库和分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)筛选出"蒲公英-夏枯草"药对的主要化学成分及作用靶点,建立"成分-靶点"蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络.利用比较毒理基因组学数据库(comparative toxicogenomics database,CTD)检索与乳腺癌相关的基因,采用Cytoscape 3.6.1软件构建"疾病-靶点"PPI网络.基于Cytoscape 3.6.1软件的Merge功能,合并"成分-靶点"和"疾病-靶点"的PPI网络,筛选出主要核心网络,借助David数据库、Reactome数据库及Omicshare平台,进行基因本体(gene ontology,GO)富集分析、京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析.通过动物实验,验证"蒲公英-夏枯草"药对的抗肿瘤作用机制.结果:筛选得到含383个节点、594条连接的"蒲公英-夏枯草"药对"成分-靶点"PPI网络,含500个靶点的乳腺癌"疾病-靶点"PPI网络.利用网络合并,最终建立了含61个核心靶点的"成分-靶点-疾病"网络.基因GO功能分析结果主要与生物过程和分子功能有关;基因KEGG通路富集分析结果与免疫系统、