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目的:探讨食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)组织中蛋白酪氨酸磷酸酶1(protein tyrosin phosphatase 1,SHP-1)基因异常低表达的表观遗传学调节机制及其临床意义.方法:所用组织标本均来自河北医科大学第四医院2008-2011年行食管癌根治术并且病理诊断为ESCC患者的癌组织及相应癌旁组织(距癌灶边缘2 cm以上),共71例.ESCC细胞株(Eca109、Kyse170、Yes-2)培养完成后,进行甲基化抑制剂5-Aza-dC或组蛋白去乙酰化酶抑制剂TSA处理,qPCR和West-ern blotting实验检测ESCC组织和细胞系中SHP-1 mRNA和蛋白的表达变化,亚硫酸氢盐基因组测序(bisulfite genome sequenc-ing,BGS)法检测ESCC细胞系中SHP-1基因启动子区CpG位点的甲基化频率,甲基化特异性PCR(methylation specific PCR,MSP)技术检测ESCC组织和细胞中SHP-1启动子区的甲基化状态,应用双荧光素酶报告基因实验检测SHP-1启动子区CpG岛甲基化对其转录活性影响.分析ESCC组织中SHP-1甲基化状态分别与临床病理特征和SHP-1 mRNA表达的关系,对组织SHP-1甲基化水平与ESCC患者生存率进行Kaplan-Meier生存分析和Log-Rank检验.结果:5-Aza-dC处理后,SHP-1 mRNA蛋白在3种细胞株中的表达显著上调(均P<0.05),同时其启动子区的甲基化程度均明显降低(均P<0.

作者:刘磊;张少为;刘新波;刘俊峰

来源:中国肿瘤生物治疗杂志 2020 年 27卷 6期

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作者:
刘磊;张少为;刘新波;刘俊峰
来源:
中国肿瘤生物治疗杂志 2020 年 27卷 6期
标签:
食管鳞状细胞癌 蛋白酪氨酸磷酸酶1基因 启动子 甲基化 预后评估
目的:探讨食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)组织中蛋白酪氨酸磷酸酶1(protein tyrosin phosphatase 1,SHP-1)基因异常低表达的表观遗传学调节机制及其临床意义.方法:所用组织标本均来自河北医科大学第四医院2008-2011年行食管癌根治术并且病理诊断为ESCC患者的癌组织及相应癌旁组织(距癌灶边缘2 cm以上),共71例.ESCC细胞株(Eca109、Kyse170、Yes-2)培养完成后,进行甲基化抑制剂5-Aza-dC或组蛋白去乙酰化酶抑制剂TSA处理,qPCR和West-ern blotting实验检测ESCC组织和细胞系中SHP-1 mRNA和蛋白的表达变化,亚硫酸氢盐基因组测序(bisulfite genome sequenc-ing,BGS)法检测ESCC细胞系中SHP-1基因启动子区CpG位点的甲基化频率,甲基化特异性PCR(methylation specific PCR,MSP)技术检测ESCC组织和细胞中SHP-1启动子区的甲基化状态,应用双荧光素酶报告基因实验检测SHP-1启动子区CpG岛甲基化对其转录活性影响.分析ESCC组织中SHP-1甲基化状态分别与临床病理特征和SHP-1 mRNA表达的关系,对组织SHP-1甲基化水平与ESCC患者生存率进行Kaplan-Meier生存分析和Log-Rank检验.结果:5-Aza-dC处理后,SHP-1 mRNA蛋白在3种细胞株中的表达显著上调(均P<0.05),同时其启动子区的甲基化程度均明显降低(均P<0.