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目的:通过转录组测序技术全方位、深层次挖掘甘肃岷县当归的基因组资源,并进行当归同源基因分析,为当归栽培、品种鉴定、加工、配伍及保健品开发提供理论支撑.方法:岷县现场采集当归样品,并经专家鉴定为当归品种(angelica sinensis(oliv.)diels).采用RNA plant Plus方法提取岷归头、岷归尾的总RNA,质量鉴定合格后构建测序文库.测序文库检测合格后在Illummina HiSeq 2000测序仪上完成双端测序.采用相关生物信息学分析软件,实现研究目标.结果:①通过转录组测序技术,获取了63585个当归表达序列标签(EST),构建了当归的基因组.②在UniProt(date:2012.09)数据库中注释的30432个当归基因,分布于939种物种;其中序列分布频率较高的前5种物种为葡萄、蓖麻、毛果杨、大豆、苜蓿属.结论:当归基因组研究处于起步阶段,亟待深入研究.已注释基因主要分布于目前研究较深入的5种重要经济植物,成为当归制剂与保健品开发的分子生物学基础.

作者:王金权;杨杰;练成;丁维俊;李炜弘;王米渠

来源:中国中医药科技 2014 年 21卷 4期

知识库介绍

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作者:
王金权;杨杰;练成;丁维俊;李炜弘;王米渠
来源:
中国中医药科技 2014 年 21卷 4期
标签:
转录组测序技术 当归 同源基因 道地药材
目的:通过转录组测序技术全方位、深层次挖掘甘肃岷县当归的基因组资源,并进行当归同源基因分析,为当归栽培、品种鉴定、加工、配伍及保健品开发提供理论支撑.方法:岷县现场采集当归样品,并经专家鉴定为当归品种(angelica sinensis(oliv.)diels).采用RNA plant Plus方法提取岷归头、岷归尾的总RNA,质量鉴定合格后构建测序文库.测序文库检测合格后在Illummina HiSeq 2000测序仪上完成双端测序.采用相关生物信息学分析软件,实现研究目标.结果:①通过转录组测序技术,获取了63585个当归表达序列标签(EST),构建了当归的基因组.②在UniProt(date:2012.09)数据库中注释的30432个当归基因,分布于939种物种;其中序列分布频率较高的前5种物种为葡萄、蓖麻、毛果杨、大豆、苜蓿属.结论:当归基因组研究处于起步阶段,亟待深入研究.已注释基因主要分布于目前研究较深入的5种重要经济植物,成为当归制剂与保健品开发的分子生物学基础.