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通过SciFinder及CNKI数据库完成化合物搜索,并在FAFdurgs4、SEA Search Server数据库进行类药性筛选,结合在OMIM、GeneCards、DurgBank等疾病靶点数据库中搜索到的急性心肌缺血相关靶点集,并借助Cytoscape软件建立"化学成分-靶点-通路-疾病"网络,预测矮紫堇抗急性心肌缺血的潜在活性成分.通过STRING数据库构建蛋白互作(PPI)网络并预测网络中的核心靶点,利用DAVID数据库、R软件对核心靶点进行富集分析,最后利用Autodock Vina等软件将网络中预测到的潜在活性成分与核心靶点进行分子对接验证.结果显示,矮紫堇与急性心肌缺血相关的化合物共60个,涉及73个潜在的靶点,GO功能富集分析得到282条生物学过程(BP)、49条细胞成分(CC)、78条分子功能(MF);KEGG富集到85条通路,涉及酒精中毒通路、内分泌抵抗通路、钙离子信号通路、cAMP信号通路、血管内皮生长因子信号通路及心肌细胞的肾上腺素能信号转导通路等.网络拓扑分析结果表明,矮紫堇抗急性心肌缺血的关键成分可能为四氢巴马汀、四氢非洲防己碱、V-反式-阿魏酰去甲辛弗林、N-顺式-对香豆酰去甲辛弗林、N-反式-对香豆酰去甲肾上腺素、N-反式-对香豆酰去甲辛弗林,核心靶点包括CDH23、SCN4B、NFASC.分子对接结果显示,矮紫堇的关键成分与核心靶点具有稳定的结合活性.

作者:周晓春;黄美雯;焦顺刚;戈福星;陈攀龙;刘长鑫;高小力;屠鹏飞;柴兴云

来源:中国中药杂志 2021 年 46卷 12期

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周晓春;黄美雯;焦顺刚;戈福星;陈攀龙;刘长鑫;高小力;屠鹏飞;柴兴云
来源:
中国中药杂志 2021 年 46卷 12期
标签:
矮紫堇 急性心肌缺血 网络药理学 分子对接 药效物质 作用机制
通过SciFinder及CNKI数据库完成化合物搜索,并在FAFdurgs4、SEA Search Server数据库进行类药性筛选,结合在OMIM、GeneCards、DurgBank等疾病靶点数据库中搜索到的急性心肌缺血相关靶点集,并借助Cytoscape软件建立"化学成分-靶点-通路-疾病"网络,预测矮紫堇抗急性心肌缺血的潜在活性成分.通过STRING数据库构建蛋白互作(PPI)网络并预测网络中的核心靶点,利用DAVID数据库、R软件对核心靶点进行富集分析,最后利用Autodock Vina等软件将网络中预测到的潜在活性成分与核心靶点进行分子对接验证.结果显示,矮紫堇与急性心肌缺血相关的化合物共60个,涉及73个潜在的靶点,GO功能富集分析得到282条生物学过程(BP)、49条细胞成分(CC)、78条分子功能(MF);KEGG富集到85条通路,涉及酒精中毒通路、内分泌抵抗通路、钙离子信号通路、cAMP信号通路、血管内皮生长因子信号通路及心肌细胞的肾上腺素能信号转导通路等.网络拓扑分析结果表明,矮紫堇抗急性心肌缺血的关键成分可能为四氢巴马汀、四氢非洲防己碱、V-反式-阿魏酰去甲辛弗林、N-顺式-对香豆酰去甲辛弗林、N-反式-对香豆酰去甲肾上腺素、N-反式-对香豆酰去甲辛弗林,核心靶点包括CDH23、SCN4B、NFASC.分子对接结果显示,矮紫堇的关键成分与核心靶点具有稳定的结合活性.