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运用网络药理学及分子对接技术探究绞股蓝治疗代谢相关脂肪性肝病(metabolic associated fatty liver disease,MAFLD)的作用机制.利用TCMSP数据库收集绞股蓝的主要活性成分及作用靶点,通过GeneCards、OMIM、TTD数据库获取疾病相关靶点,并筛选出3个数据库交集靶点后,在UniProt数据库转换为标准基因名称,经Venn工具获取药物-疾病交集靶点基因,将交集靶点基因上传至STRING数据库构建蛋白相互作用网络,并利用Cytoscape软件进行"药物-活性成分-共同靶点-疾病"网络的构建与分析.借助DAVID数据库对交集靶点进行基因本体(gene ontology,GO)分析和基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)信号通路富集分析.运用Pymol软件对药物活性成分与共同靶点进行分子对接和结合能力预测.结果共筛选出绞股蓝皂苷、槲皮素、谷甾醇等绞股蓝有效活性成分24个,包括作用靶点92个,与代谢相关脂肪性肝病共同靶点54个,关键靶点包括TNF、IL6、PTGS2、TP53、CCL2、VEGFA等.分析GO生物过程、分子功能、细胞组分及KEGG通路相关条目,主要涉及NF-KB、PI3K-Akt、TNF及HIF-1等信号通路.分子对接结果显示,绞股蓝皂苷、槲皮素与TNF、IL6、PTGS2具有强烈的结合能力.该研究发现绞股蓝可能从抗炎、抗氧化应激、改善胰岛素抵抗

作者:李淑娣;李素领;刘江凯;王振;袁培培

来源:中国中药杂志 2021 年 46卷 19期

知识库介绍

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作者:
李淑娣;李素领;刘江凯;王振;袁培培
来源:
中国中药杂志 2021 年 46卷 19期
标签:
绞股蓝;代谢相关脂肪性肝病;网络药理学;信号通路;分子对接
运用网络药理学及分子对接技术探究绞股蓝治疗代谢相关脂肪性肝病(metabolic associated fatty liver disease,MAFLD)的作用机制.利用TCMSP数据库收集绞股蓝的主要活性成分及作用靶点,通过GeneCards、OMIM、TTD数据库获取疾病相关靶点,并筛选出3个数据库交集靶点后,在UniProt数据库转换为标准基因名称,经Venn工具获取药物-疾病交集靶点基因,将交集靶点基因上传至STRING数据库构建蛋白相互作用网络,并利用Cytoscape软件进行"药物-活性成分-共同靶点-疾病"网络的构建与分析.借助DAVID数据库对交集靶点进行基因本体(gene ontology,GO)分析和基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)信号通路富集分析.运用Pymol软件对药物活性成分与共同靶点进行分子对接和结合能力预测.结果共筛选出绞股蓝皂苷、槲皮素、谷甾醇等绞股蓝有效活性成分24个,包括作用靶点92个,与代谢相关脂肪性肝病共同靶点54个,关键靶点包括TNF、IL6、PTGS2、TP53、CCL2、VEGFA等.分析GO生物过程、分子功能、细胞组分及KEGG通路相关条目,主要涉及NF-KB、PI3K-Akt、TNF及HIF-1等信号通路.分子对接结果显示,绞股蓝皂苷、槲皮素与TNF、IL6、PTGS2具有强烈的结合能力.该研究发现绞股蓝可能从抗炎、抗氧化应激、改善胰岛素抵抗