通过生物信息学技术分析比较认知完好的老年人(60~ 99岁)与中青年人(20~59岁)脑部海马组织(hippocampal tissue,HC)的基因芯片数据,初步筛选出差异表达基因,进而预测治疗脑老化的潜在中药药物.从基因表达数据库(Gene Ex-pression Omnibus,GEO)下载GSE11882基因芯片,基于R语言软件筛选差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),通过STRING数据库、Cytoscape软件及其插件分析得到差异表达基因的关键基因,对关键基因进行基因本体论(Gene Ontology,GO)及京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)分析,通过关键基因与医学本体信息检索平台(Coremine Medical)相互映射,筛选治疗脑老化的中药,并构建"药物-活性成分-作用靶点"网络.筛选出268个差异表达基因,包括246个下调基因和22个上调基因.差异表达基因共得出15个关键基因,关键基因主要参与白细胞迁移、中性粒细胞活化、细胞趋化运动、小胶质细胞活化、免疫效应过程的调节等生物过程.KEGG通路分析显示关键基因主要富集于炎症过程、免疫反应、细胞因子-细胞因子受体相互作用、PI3K-Akt信号通路、Rapl信号通路、趋化因子信号通路、Toll样受体信号通路、产生IgA的肠道免疫网络通路等.筛选得到治疗脑老化的潜在中药为三
作者:吴丹;王雪;杨静;吴烨;刘逸南;修成奎;王佳丽;刘奕清;雷燕
来源:中国中药杂志 2021 年 46卷 21期