借助中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)、BATMAN-TCM数据库(Bioinformatics Analysis Tool for Molecular Mechanismof Traditional Chinese Medicine)对少腹逐瘀汤的有效成分及靶点进行检索,于比较毒物基因组学数据库(Comparative Toxicogenomics Database,CTD)、治疗靶点数据库(Therapeutic Target Database,TTD)、人类基因数据库(The Human Gene Database,GeneCards)、疾病相关的基因与突变位点数据库(DisGeNET)中,分别以"endometriosis""dysmenorrhea"为关键词,获取子宫内膜异位症和痛经的相关靶点.通过Cytoscape 3.8.0构建"中药-有效成分-治疗靶点"网络.借助STRING 11.0数据库构建蛋白互作网络,同时借助Cytoscape 3.8.0软件中Analyze Network插件计算网络中节点的拓扑参数,筛选出网络中起重要作用的蛋白质.将潜在治疗靶点导人RStudio软件,利用clusterProfiler包对潜在治疗靶点进行基因本体论(Gene Ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析.最后,借助AutoDock Vina(Vina)平台进行分子对接,预测少腹逐瘀汤主要有效成分与关键靶点的结合度.通过筛选得到少腹逐瘀汤有效成分136个,靶点380个;子宫内膜异位症相关靶点1627个,痛经相关靶点142个,
作者:陈元欢;张作良;武权生;冯鹏;乔新颖;张小花;毛海燕;蔡爽;周小静
来源:中国中药杂志 2021 年 46卷 24期