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目的 了解手足口病(HFMD)患儿标本中分离到的柯萨奇病毒A10型(Coxsackie virus A10,CVA10)山东地方株VP1区基因特征.方法 采集2008年至2009年部分HFMD病例临床标本,细胞培养方法分离病毒,提取病毒核酸,RT-PCR扩增病毒VP1区序列,生物信息学方法鉴定其基因型别.选择代表性CVA10毒株,与GenBank中检索到的其他CVA10毒株进行核苷酸和氨基酸同源性分析,并以VP1部分序列构建亲缘进化树.结果 从山东省HFMD患儿的760份临床标本中分离出330株病毒,其中有17株分子定型鉴定为CVA10.CVA10山东地方株彼此间核苷酸和氨基酸的同源性分别在82.3

作者:杨赫;陶泽新;王海岩;李岩;樊庆莹;冯艺;李忠;王显军;徐爱强

来源:中华传染病杂志 2010 年 28卷 7期

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作者:
杨赫;陶泽新;王海岩;李岩;樊庆莹;冯艺;李忠;王显军;徐爱强
来源:
中华传染病杂志 2010 年 28卷 7期
标签:
手足口病 柯萨奇病毒A10型 基因型 序列分析 Hand,foot and mouth disease Coxsackie virus A10 Genotype Sequence analysis
目的 了解手足口病(HFMD)患儿标本中分离到的柯萨奇病毒A10型(Coxsackie virus A10,CVA10)山东地方株VP1区基因特征.方法 采集2008年至2009年部分HFMD病例临床标本,细胞培养方法分离病毒,提取病毒核酸,RT-PCR扩增病毒VP1区序列,生物信息学方法鉴定其基因型别.选择代表性CVA10毒株,与GenBank中检索到的其他CVA10毒株进行核苷酸和氨基酸同源性分析,并以VP1部分序列构建亲缘进化树.结果 从山东省HFMD患儿的760份临床标本中分离出330株病毒,其中有17株分子定型鉴定为CVA10.CVA10山东地方株彼此间核苷酸和氨基酸的同源性分别在82.3