目的 探讨柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CV-A16)分离株VP1基因变异情况.方法 选择2015年1月至2017年6月昆明地区手足口病(hand,foot,and mouth disease,HFMD)CV-A16阳性患者160例,采用实时荧光PCR检测患者粪便标本中的CV-A16病毒核酸,对CV-A16阳性样本进行反转录PCR扩增VP1基因,扩增阳性产物进行测序和序列比对,分析同源性并确定其所属基因亚型,构建种系遗传进化发育树,并进行同源建模.结果 160株CV-A16毒株均为B2亚型.CV-A16毒株与福建省、北京市、南京市等地区CV-A16型流行毒株遗传距离为0.76,与马来西亚流行毒株的遗传距离为0.78,与澳大利亚流行毒株的遗传距离为1.86.同源建模发现CV-A16 VP1基因的氨基酸序列发生了G227R突变.结论 CV-A16毒株3年间未发生大的基因遗传变异,毒株亲缘关系与国内北京市、福建省等地区和马来西亚地区分离毒株的遗传距离近,与澳大利亚地区的流行毒株遗传距离远.
作者：王杨；李祎；彭传梅；王佳；付晓野；陈婉婷；高辉
来源：中华传染病杂志 2019 年 37卷 3期
