目的 探讨微重力环境对小鼠成纤维细胞应激损伤相关miRNA表达的影响.方法 体外培养L929细胞,应用简单随机方法分为模拟微重力(SMG)组(SMG组)和正常重力(NG)对照组(NG组).细胞培养7d,提取样本总RNA行荧光标记和芯片杂交,采用Feature Extraction软件处理杂交图像提取原始数据,应用Genespring软件进行分位数标准化和后续处理,筛选差异表达显著的miRNA,qRT-PCR验证芯片结果准确性.通过miRNA靶基因预测数据库TargetScan和microRNAorg对差异miRNA进行靶基因预测,其交集作为潜在调节靶基因,对预测靶基因分别进行基因本体和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,判定差异miRNA主控的生物学过程和(或)信号通路.结合mRNA差异表达谱行miRNA-mRNA联合分析,并构建miRNA-mRNA功能网络和miRNA-mRNA调控网络. 结果 miRNA芯片检测发现,L929细胞在模拟微重力环境下较正常重力环境下差异表达的miRNA有21个,4个显著上调,包括mmu-miR-669j、-122-5p、-30a-3p和-6516-3p,其中mmu-miR-669j上调最为显著(52.84倍,P＜0.05);17个显著下调,包括mmu-miR-21a-3p、-miR-28a-5p、-218-5p、-210-3p、-miR-19a-3p、-miR-31-3p-miR-19b-3p等,其中mmu-miR-28a-5p下调最为显著(15.47倍,P＜0.05).qRT-PCR结果与miRNA芯片结果一致(P＜0.05).

作者：宋向卫；王占宇；姜玉峰；徐冰心；司少艳；周金莲；杨鹤鸣；李成林；崔彦

来源：中华创伤杂志 2017 年 33卷 8期