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目的 应用公开数据库寻找可能与梅尼埃病(Meniere's disease,MD)发病机制相关的基因和分子途径,以及筛选MD潜在治疗药物.方法 通过Gene Expression Omnibus(GEO)数据库获取GSE109558数据集,筛选MD与正常样本间外周单核细胞的差异表达基因,并进行功能注释、通路分析和蛋白质-蛋白质相互作用PPI(Protein-protein interaction,PPI)网络构建.最后应用Connectivity map(cMAP)数据库筛选潜在治疗MD的小分子药物.结果 差异表达基因显著富集在对病毒的反应、防御反应、趋化、MHC II类蛋白结合等生物过程,以及Influenza A和Herpes simplex infection信号通路.网络分析发现一些核心基因,如CXCL10、IFI44L.筛选出33个治疗MD的候选小分子药物,如赖诺普利、柚皮素等.结论 MD可能具有自身炎症性内耳疾病,外周单核细胞中CXCL10、IFI44L、IFI44、XAF1、OAS2、HERC5、EIF2AK2表达水平的升高和POTEE表达水平的降低可能与MD发病机制有关.筛选出的小分子药物,如赖诺普利、柚皮素、伏立诺他等有可能成为MD的治疗或者辅助药物.

作者:黄巧;翟思佳;廖行伟;刘宇超;尹时华

来源:中华耳科学杂志 2020 年 18卷 4期

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作者:
黄巧;翟思佳;廖行伟;刘宇超;尹时华
来源:
中华耳科学杂志 2020 年 18卷 4期
标签:
梅尼埃病 基因表达谱 药物发现
目的 应用公开数据库寻找可能与梅尼埃病(Meniere's disease,MD)发病机制相关的基因和分子途径,以及筛选MD潜在治疗药物.方法 通过Gene Expression Omnibus(GEO)数据库获取GSE109558数据集,筛选MD与正常样本间外周单核细胞的差异表达基因,并进行功能注释、通路分析和蛋白质-蛋白质相互作用PPI(Protein-protein interaction,PPI)网络构建.最后应用Connectivity map(cMAP)数据库筛选潜在治疗MD的小分子药物.结果 差异表达基因显著富集在对病毒的反应、防御反应、趋化、MHC II类蛋白结合等生物过程,以及Influenza A和Herpes simplex infection信号通路.网络分析发现一些核心基因,如CXCL10、IFI44L.筛选出33个治疗MD的候选小分子药物,如赖诺普利、柚皮素等.结论 MD可能具有自身炎症性内耳疾病,外周单核细胞中CXCL10、IFI44L、IFI44、XAF1、OAS2、HERC5、EIF2AK2表达水平的升高和POTEE表达水平的降低可能与MD发病机制有关.筛选出的小分子药物,如赖诺普利、柚皮素、伏立诺他等有可能成为MD的治疗或者辅助药物.