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目的 本研究通过蛋白质组学的方法比较类风湿关节炎(RA)、骨关节炎及强直性脊柱炎(AS)滑膜组织中表达的蛋白,筛选RA滑膜中表达特异性下调的蛋白,并通过单核苷酸多态性(SNPs)分析方法分析靶蛋白编码基因对RA的遗传易感性.方法 提取RA( 10例)、骨关节炎(10例)及AS(10例)滑膜组织总蛋白,每类疾病的样本等比例混合,然后用2-D凝胶电泳进行分析,对RA样本中表达量明显低于骨关节炎和AS的蛋白进行飞行时间质谱鉴定,检测结果用蛋白印迹法验证.用Taqman方法对中国人群中267例RA患者和160名健康对照的维生素D结合蛋白(VDBP)编码基因的标签SNPs进行基因分型,并扩大样本量(389例RA和371名健康对照)验证分型结果.采用单因素方差分析和Fisher确切概率法进行检验.结果 蛋白质组学研究发现,在RA患者滑膜中VDBP表达量明显下降,蛋白印迹法也验证了这一结果.基因分型研究发现,SNP位点rs2282679与RA密切相关(P=0.026 794).进一步扩大样本实验也得出了一致结果,rs2282679与RA有相关性[比值比(OR )=0.678 639,95%可信区间(CI)0.541 113~0.851 118,P=0.000 776].结论 与骨关节炎和AS患者相比,VDBP在RA患者滑膜中表达量明显下降.VDBP基因上的SNP位点rs2282679与RA有相关性.VDBP在RA中的表达下调及其基因的遗传效应显示VDBP可能参

作者:王月俭;房克华;赵丹;潘继红;赵燕;张云忠;常晓天

来源:中华风湿病学杂志 2012 年 16卷 6期

知识库介绍

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作者:
王月俭;房克华;赵丹;潘继红;赵燕;张云忠;常晓天
来源:
中华风湿病学杂志 2012 年 16卷 6期
标签:
蛋白质组学 关节炎,类风湿 维生素D结合蛋白质 多态性,单核苷酸 Proteomics Arthritis,rheumatoid Vitamin D-binding protein Polymorphism,single nucleotide
目的 本研究通过蛋白质组学的方法比较类风湿关节炎(RA)、骨关节炎及强直性脊柱炎(AS)滑膜组织中表达的蛋白,筛选RA滑膜中表达特异性下调的蛋白,并通过单核苷酸多态性(SNPs)分析方法分析靶蛋白编码基因对RA的遗传易感性.方法 提取RA( 10例)、骨关节炎(10例)及AS(10例)滑膜组织总蛋白,每类疾病的样本等比例混合,然后用2-D凝胶电泳进行分析,对RA样本中表达量明显低于骨关节炎和AS的蛋白进行飞行时间质谱鉴定,检测结果用蛋白印迹法验证.用Taqman方法对中国人群中267例RA患者和160名健康对照的维生素D结合蛋白(VDBP)编码基因的标签SNPs进行基因分型,并扩大样本量(389例RA和371名健康对照)验证分型结果.采用单因素方差分析和Fisher确切概率法进行检验.结果 蛋白质组学研究发现,在RA患者滑膜中VDBP表达量明显下降,蛋白印迹法也验证了这一结果.基因分型研究发现,SNP位点rs2282679与RA密切相关(P=0.026 794).进一步扩大样本实验也得出了一致结果,rs2282679与RA有相关性[比值比(OR )=0.678 639,95%可信区间(CI)0.541 113~0.851 118,P=0.000 776].结论 与骨关节炎和AS患者相比,VDBP在RA患者滑膜中表达量明显下降.VDBP基因上的SNP位点rs2282679与RA有相关性.VDBP在RA中的表达下调及其基因的遗传效应显示VDBP可能参