您的账号已在其他设备登录,您当前账号已强迫下线,
如非您本人操作,建议您在会员中心进行密码修改

确定
收藏 | 浏览170 | 下载160

目的:探讨OA患者血浆微RNA(miRNA)表达谱特征,并对差异表达的miRNA进行生物信息学分析,寻找与OA相关的血浆生物标记物。方法:收集20例OA患者及15名健康体检者静脉血,通过Agilent miRNA芯片表达谱检测OA血浆miRNA的表达谱。对差异表达的miRNA进行靶基因预测,聚类分析(GO)功能分析及KEEG通路聚类分析等生物信息学分析。最后选取独立验证样本采用方差分析对差异表达miRNA进行实时荧光定量-PCR验证,并评估效能。组间差异采用 t检验分析。 结果:①与健康对照组相比,OA组筛选获得74个差异表达血浆miRNA,其中45个表达上调,29个表达下调。②预测差异性表达miRNA潜在靶基因2 731个,参与到462个KEGG通路条目中,主要富集于环磷酸腺苷(cAMP)信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、破骨细胞分化等通路,主要功能集中在细胞间黏附作用、胶原合成作用、细胞内信号转导等生物学功能上。③ RT-PCR显示OA患者血浆miR-20a-5p、miR-320c表达水平明显升高( t=-6.142, P<0.05; t=-3.854, P<0.05),而miR-940表达明显下调( t=2.767, P<0.05),变化趋势与芯片结果一致。受试者工作特征曲线(ROC)显示这3个miRNA的曲线下面积(AUC)分别为0.864

作者:赵丽珂;周荣伟;张春媚;王钱;黄慈波

来源:中华风湿病学杂志 2020 年 24卷 3期

知识库介绍

临床诊疗知识库该平台旨在解决临床医护人员在学习、工作中对医学信息的需求,方便快速、便捷的获取实用的医学信息,辅助临床决策参考。该库包含疾病、药品、检查、指南规范、病例文献及循证文献等多种丰富权威的临床资源。

详细介绍
热门关注
免责声明:本知识库提供的有关内容等信息仅供学习参考,不代替医生的诊断和医嘱。

收藏
| 浏览:170 | 下载:160
作者:
赵丽珂;周荣伟;张春媚;王钱;黄慈波
来源:
中华风湿病学杂志 2020 年 24卷 3期
标签:
骨关节炎 微RNAs 靶基因 生物信息 Osteoarthritis MicroRNAs Target gene Bioinformatic
目的:探讨OA患者血浆微RNA(miRNA)表达谱特征,并对差异表达的miRNA进行生物信息学分析,寻找与OA相关的血浆生物标记物。方法:收集20例OA患者及15名健康体检者静脉血,通过Agilent miRNA芯片表达谱检测OA血浆miRNA的表达谱。对差异表达的miRNA进行靶基因预测,聚类分析(GO)功能分析及KEEG通路聚类分析等生物信息学分析。最后选取独立验证样本采用方差分析对差异表达miRNA进行实时荧光定量-PCR验证,并评估效能。组间差异采用 t检验分析。 结果:①与健康对照组相比,OA组筛选获得74个差异表达血浆miRNA,其中45个表达上调,29个表达下调。②预测差异性表达miRNA潜在靶基因2 731个,参与到462个KEGG通路条目中,主要富集于环磷酸腺苷(cAMP)信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、破骨细胞分化等通路,主要功能集中在细胞间黏附作用、胶原合成作用、细胞内信号转导等生物学功能上。③ RT-PCR显示OA患者血浆miR-20a-5p、miR-320c表达水平明显升高( t=-6.142, P<0.05; t=-3.854, P<0.05),而miR-940表达明显下调( t=2.767, P<0.05),变化趋势与芯片结果一致。受试者工作特征曲线(ROC)显示这3个miRNA的曲线下面积(AUC)分别为0.864