目的 筛选电离辐射诱导的长链非编码RNA LOC102606465靶基因,探索其潜在生物学功能.方法 基因芯片检测LOC102606465下游差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),qRT-PCR对部分DEGs进行验证.对DEGs进行GO和KEGG功能富集分析,构建PPI蛋白互作网络,以筛选显著模块及关键枢纽基因.结果 siRNA-447和siRNA-541的LOC102606465表达量显著低于siRNA-NC,差异具有统计学意义(t=29.095、13.751,P<0.01).siRNA-447,siRNA-541共同变化的DEGs有374个(112个上调,262个下调).qRT-PCR验证发现DEGs表达变化趋势与基因芯片结果一致.GO富集分析发现,下调DEGs显著富集于"氧化还原酶活性作用集群"(分子功能),"基底层"(细胞组分),"铵离子代谢过程"(生物过程);上调DEGs显著富集于"蛋白磷酸酶抑制剂活性"(分子功能),"SNARE复合体"(细胞组分),"纤维蛋白溶解负调节"(生物过程).KEGG分析发现,DEGs显著富集在外源物质细胞色素P450代谢通路,背腹轴形成信号通路,溶酶体信号通路,甘油酯代谢通路和P53信号通路.基于STRING数据库构建蛋白互作网络(包括194个节点与268个边缘),筛选出1个显著功能模块和5个关键枢纽基因ACTRT3、CDKN1A、DPYD、TMP4、PRKACB.结论 LOC102606465可能是调节电离辐射敏感性潜在的生物标志物,其表达下调在
作者:余昶;王琪;刘瑞雪;黄金凤;王治东;周美娟
来源:中华放射医学与防护杂志 2019 年 39卷 11期