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目的:应用蛋白质非标记定量技术和生物信息学分析筛查脊髓损伤(spinal cord injury,SCI)患者血浆外泌体蛋白分子标志物。方法:收集2021年1月至2022年6月南京医科大学第一附属医院SCI患者及健康对照人群血浆标本各50份。使用超速离心法分离血浆外泌体,通过透射电子显微镜、纳米粒子跟踪分析和Western blot对外泌体进行鉴定。利用Label-Free定量蛋白质组学分析血浆外泌体差异表达蛋白(differentially expressed proteins,DEPs),并基于基因本体(Gene Ontology,GO)和基因功能和基因组信息(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)数据库对DEPs进行表征、注释和富集分析。利用血浆外泌体标本对筛选出的DEPs进行Western blot和酶联免疫吸附试验(enzyme linked immunosorbent assay,ELISA)验证。结果:根据美国脊柱损伤协会脊髓损伤分级:A级14例、B级19例、C级12例、D级5例。SCI患者的血浆外泌体与对照组外泌体均呈现典型的杯状形态,直径30~200 nm。经蛋白质非标记定量技术共鉴定出493种外泌体蛋白,筛选出126种蛋白质差异表达,其中38种上调、88种下调。GO注释显示了DEPs主要参与蛋白质激活级联、补体激活和免疫反应等功能。KEGG富集分析显示了DEPs参与补体和凝血级联反应、蛋白酶体

作者:戎玉罗;王壮晖;唐鹏宇;周炜;凡进;张文志;周许辉;曹晓建;殷国勇;蔡卫华

来源:中华骨科杂志 2023 年 43卷 14期

知识库介绍

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作者:
戎玉罗;王壮晖;唐鹏宇;周炜;凡进;张文志;周许辉;曹晓建;殷国勇;蔡卫华
来源:
中华骨科杂志 2023 年 43卷 14期
标签:
脊髓损伤 血浆 外泌体 生物标记 蛋白质组学 钙粒蛋白B Spinal cord injuries Plasma Exosomes Biomarkers Proteomics Calgranulin B
目的:应用蛋白质非标记定量技术和生物信息学分析筛查脊髓损伤(spinal cord injury,SCI)患者血浆外泌体蛋白分子标志物。方法:收集2021年1月至2022年6月南京医科大学第一附属医院SCI患者及健康对照人群血浆标本各50份。使用超速离心法分离血浆外泌体,通过透射电子显微镜、纳米粒子跟踪分析和Western blot对外泌体进行鉴定。利用Label-Free定量蛋白质组学分析血浆外泌体差异表达蛋白(differentially expressed proteins,DEPs),并基于基因本体(Gene Ontology,GO)和基因功能和基因组信息(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)数据库对DEPs进行表征、注释和富集分析。利用血浆外泌体标本对筛选出的DEPs进行Western blot和酶联免疫吸附试验(enzyme linked immunosorbent assay,ELISA)验证。结果:根据美国脊柱损伤协会脊髓损伤分级:A级14例、B级19例、C级12例、D级5例。SCI患者的血浆外泌体与对照组外泌体均呈现典型的杯状形态,直径30~200 nm。经蛋白质非标记定量技术共鉴定出493种外泌体蛋白,筛选出126种蛋白质差异表达,其中38种上调、88种下调。GO注释显示了DEPs主要参与蛋白质激活级联、补体激活和免疫反应等功能。KEGG富集分析显示了DEPs参与补体和凝血级联反应、蛋白酶体