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目的 探究抗合成酶综合征(ASS)患者和健康人群的肠道菌群是否存在差异.方法 选择四川大学华西医院2022 年2 月至10 月在风湿免疫科就诊的22 例 ASS患者以及26 例健康对照者作为研究对象.收集患者和健康者粪便样品的细菌总 DNA,通过Illumina MiSeq 平台对样本16S rRNA基因序列V3-V4 高变区进行PCR扩增及测序,并进行组间OTU分析、样品多样性分析、样品组间显著性差异分析及 LEfSe分析.利用Spearman相关系数计算菌属与ASS临床特征的相关性.通过随机森林分类结果绘制ROC曲线.结果 ASS组与健康对照组肠道菌群组成存在显著差异,α多样性指数(Simpson、chao1)在 ASS 组明显降低,β 多样性分析显示两组间菌群结构存在明显差异.在菌群组成上,ASS组表现为拟杆菌门减少,厚壁菌门增多.LEfSe差异分析发现 ASS组链球菌属(Streptococcus)和肠球菌属(Enterococcus)是优势菌属;而健康对照琼脂杆菌属(Agathobacter),瘤胃球菌属(Ruminococcus),拟杆菌属(Bacteroides)等产丁酸菌是优势菌属.Spearman相关系数分析结果显示志贺埃希菌属(Escherichia-Shigella)与ASS患者技工手症状正相关(r>0,P<0.05).利用7 种菌属区分ASS和健康人,AUC =0.85(95

作者:孙蕊;黎艳红;梁秀萍;程璐;赵毅

来源:中华临床免疫和变态反应杂志 2023 年 17卷 3期

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作者:
孙蕊;黎艳红;梁秀萍;程璐;赵毅
来源:
中华临床免疫和变态反应杂志 2023 年 17卷 3期
标签:
抗合成酶综合征 肠道菌群 16S rDNA 高通量测序 anti-synthetase syndrome intestinal flora 16S rDNA high-throughput sequencing
目的 探究抗合成酶综合征(ASS)患者和健康人群的肠道菌群是否存在差异.方法 选择四川大学华西医院2022 年2 月至10 月在风湿免疫科就诊的22 例 ASS患者以及26 例健康对照者作为研究对象.收集患者和健康者粪便样品的细菌总 DNA,通过Illumina MiSeq 平台对样本16S rRNA基因序列V3-V4 高变区进行PCR扩增及测序,并进行组间OTU分析、样品多样性分析、样品组间显著性差异分析及 LEfSe分析.利用Spearman相关系数计算菌属与ASS临床特征的相关性.通过随机森林分类结果绘制ROC曲线.结果 ASS组与健康对照组肠道菌群组成存在显著差异,α多样性指数(Simpson、chao1)在 ASS 组明显降低,β 多样性分析显示两组间菌群结构存在明显差异.在菌群组成上,ASS组表现为拟杆菌门减少,厚壁菌门增多.LEfSe差异分析发现 ASS组链球菌属(Streptococcus)和肠球菌属(Enterococcus)是优势菌属;而健康对照琼脂杆菌属(Agathobacter),瘤胃球菌属(Ruminococcus),拟杆菌属(Bacteroides)等产丁酸菌是优势菌属.Spearman相关系数分析结果显示志贺埃希菌属(Escherichia-Shigella)与ASS患者技工手症状正相关(r>0,P<0.05).利用7 种菌属区分ASS和健康人,AUC =0.85(95