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目的 探讨中国特应性皮炎(atopic dermatitis,AD)患者外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cells,PBMCs)转录组特征及其在度普利尤单抗疗效预测中的应用.方法 本研究共纳入56例中重度成年AD患者接受度普利尤单抗治疗,在负荷剂量600 mg后,每隔一周自行皮下给予度普利尤单抗300 mg治疗,共随访16周,并在基线和治疗16周后收集PBMCs样本.其中35例AD患者样本及另外30名健康对照进行RNA测序.使用加权基因共表达网络分析(Weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)寻找度普利尤单抗疗效预测的相关基因,并在其余21例AD患者样本中进行验证.结果 AD患者PBMCs中 Th2/Th22通路、Th17抗菌肽相关基因以及天然调节性T细胞(nTreg)丰度上调,而TGF-β信号和NK细胞信号下调.度普利尤单抗治疗逆转了 AD患者中Th2细胞因子受体表达的增加.WGCNA鉴定出两个与度普利尤单抗疗效显著相关的基因模块.通过Spearman相关性分析、ROC分析和回归分析,发现这两个模块的核心基因MAP2K3和UBE2L3对度普利尤单抗疗效表现出较强的预测能力.并且在另外21例AD患者中进一步验证了这两个基因的预测能力.结论 首次揭示了中国AD患者PBMCs的分子表型,并发现了两个可能有助于预测度普利尤单抗疗效的分子.

作者:王钰;李巍

来源:中华临床免疫和变态反应杂志 2023 年 17卷 5期

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作者:
王钰;李巍
来源:
中华临床免疫和变态反应杂志 2023 年 17卷 5期
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特应性皮炎 外周血单个核细胞 度普利尤单抗 转录组分析 加权基因共表达网络分析
目的 探讨中国特应性皮炎(atopic dermatitis,AD)患者外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cells,PBMCs)转录组特征及其在度普利尤单抗疗效预测中的应用.方法 本研究共纳入56例中重度成年AD患者接受度普利尤单抗治疗,在负荷剂量600 mg后,每隔一周自行皮下给予度普利尤单抗300 mg治疗,共随访16周,并在基线和治疗16周后收集PBMCs样本.其中35例AD患者样本及另外30名健康对照进行RNA测序.使用加权基因共表达网络分析(Weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)寻找度普利尤单抗疗效预测的相关基因,并在其余21例AD患者样本中进行验证.结果 AD患者PBMCs中 Th2/Th22通路、Th17抗菌肽相关基因以及天然调节性T细胞(nTreg)丰度上调,而TGF-β信号和NK细胞信号下调.度普利尤单抗治疗逆转了 AD患者中Th2细胞因子受体表达的增加.WGCNA鉴定出两个与度普利尤单抗疗效显著相关的基因模块.通过Spearman相关性分析、ROC分析和回归分析,发现这两个模块的核心基因MAP2K3和UBE2L3对度普利尤单抗疗效表现出较强的预测能力.并且在另外21例AD患者中进一步验证了这两个基因的预测能力.结论 首次揭示了中国AD患者PBMCs的分子表型,并发现了两个可能有助于预测度普利尤单抗疗效的分子.