目的 多参数预测广州地区人巨细胞病毒(HCMV)临床低传代病毒株UL136基因B细胞表位.方法 应用改进型自我优化预测结构(SOPMA),Garnier-Osguthorpe-Robson(GOR),人工神经网络预测法(HNN)预测二级结构;应用隐马尔可夫模型(TMHMM)预测跨膜结构;应用Hopp&Woods亲水性方案、Emini可及性方案、Jameson-Wolf抗原性方案等参数综合预测UL136基因B细胞表位.结果 HCMV UL136氨基酸包含240个氨基酸残基,相对分子质量约为27.3 kD,等电点为8.26.TMHMM预测UL136存在一个跨膜区域,为65~87aa区域,胞外区域为88~240aa区域.多参数预测显示:亲水性位于18~29、46~61、94~100、110~144、152~169、171~186、190~202、229~236aa区域;表面可及性位于19~26、49~61、89~97、110~127、161~167、173~182、196~202、229~234aa区域;极性位于18~29、31~36、51~59、94~102、111~130、155~163、178~182aa区域;柔韧性位于18~28、46~60、115~142、148~156、160~205、226~236aa区域;抗原性位于4~9、16~32、45~62、92~101、106~144、150~157、160~206、228~240aa区域.二级结构预测显示:以α-螺旋为主,无规则卷及β-转角区域主要位于5~10、45~61、108~113、129~139、163~182、187~192、195~204、229~234aa区域.ABCpred服务器综合分析显示:45~60、1
作者:晏翠芳;胡兢晶;伍苑宾;郭梦杰;潘丽雯;苏海浩;戴津;谭琪琪;王波
来源:中华临床医师杂志(电子版) 2017 年 11卷 7期