目的研究中国艾滋病病毒1型(HIV-1)AE循环重组型(CRF01-AE)毒株env不同基因区序列变异的特点及其与进化压力的关系.方法应用巢式聚合酶链反应(nested-PCR)对从全国部分省收集来的HIV-1感染者血液样本中的HIV-1 外膜蛋白(env)基因进行扩增和亚型鉴定后,选择34份CRF01-AE重组型HIV-1毒株env基因V3～V4区及其邻近区域的序列进行系统进化树和氨基酸变异分析,并计算和分析氨基酸同义替换(Ks)值和非同义替换(Ka)值及Ks/Ka比值.结果基因系统树显示中国的34份样本CRF01-AE重组型毒株与我国代表株AE.97CNGX2F和泰国代表株AE.CM240、AE.93TH253聚集在一起.氨基酸替换主要发生在C3和V4区,而V3区和V3上游区氨基酸序列相对保守,糖基化位点也比较保守.V3环顶端四肽以GPGQ为主(87.50
作者：梁浩；邢辉；魏民；陈钊；关琪；黄海龙；全宇；陈健平；洪坤学；施侣元；邵一鸣
来源：中华流行病学杂志 2003 年 24卷 11期
