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目的 了解云南省目前HIV-1流行株的基因型及其地区和人群分布.方法 收集2008-2009年云南省15个地市788例HIV感染者/艾滋病患者(HIV/AIDS)的血浆标本和背景信息,采用RT-PCR法分别扩增HIV-1 gag、pol全长基因(1584 bp和3147 bp)及env基因的C2V3片段(558 bp),序列编辑后用Genotyping及Mega 5.03软件工具确定病毒基因型,分析HIV-1株的地区和人群分布特征.结果 788例标本获得1728条HIV-1基因序列,其中全长gag基因序列599条、全长pol基因序列564条、env基因C2V3区序列525条,确定617例基因亚型,构成比分别为CRF08 BC(50.2%)、CRF01 AE(25.0%)、未知重组(10.2%)、CRF07_BC(9.2%)、C亚型(2.9%)和B(B')亚型(2.4%).HIV-1株在云南省具有地域分布特征,可分为以临沧和昆明为代表的CRF08_BC为主的地区,以德宏和西双版纳为代表的CRF08 _BC与CRF01 _AE构成比相近的地区;未知重组型在云南省少数民族中所占比例(17.0%)显著高于汉族(6.7%);异性性传播感染者和静脉注射吸毒感染者的CRF08 BC亚型均占总数的50.0%以上,但前者CRF01_AE的构成比占约30.0%,后者未知重组型和CRF07 BC的比例分别达到约15.0%.未知重组病毒株呈现两种重组模式,分别为B(B')/C重组和以CRF01 AE为母株嵌入B(B ')和/或C片段重组,并以前者为主(7

作者:杨绍敏;李惠琴;陈立力;李林;刘永健;钟敏;李健健;杨壁珲;高丽;樊移山;李敬云

来源:中华流行病学杂志 2012 年 33卷 8期

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作者:
杨绍敏;李惠琴;陈立力;李林;刘永健;钟敏;李健健;杨壁珲;高丽;樊移山;李敬云
来源:
中华流行病学杂志 2012 年 33卷 8期
标签:
艾滋病毒1型 基因型 分子流行病学 Human immunodeficiency virus type 1 Genetic subtype Molecular epidemiology
目的 了解云南省目前HIV-1流行株的基因型及其地区和人群分布.方法 收集2008-2009年云南省15个地市788例HIV感染者/艾滋病患者(HIV/AIDS)的血浆标本和背景信息,采用RT-PCR法分别扩增HIV-1 gag、pol全长基因(1584 bp和3147 bp)及env基因的C2V3片段(558 bp),序列编辑后用Genotyping及Mega 5.03软件工具确定病毒基因型,分析HIV-1株的地区和人群分布特征.结果 788例标本获得1728条HIV-1基因序列,其中全长gag基因序列599条、全长pol基因序列564条、env基因C2V3区序列525条,确定617例基因亚型,构成比分别为CRF08 BC(50.2%)、CRF01 AE(25.0%)、未知重组(10.2%)、CRF07_BC(9.2%)、C亚型(2.9%)和B(B')亚型(2.4%).HIV-1株在云南省具有地域分布特征,可分为以临沧和昆明为代表的CRF08_BC为主的地区,以德宏和西双版纳为代表的CRF08 _BC与CRF01 _AE构成比相近的地区;未知重组型在云南省少数民族中所占比例(17.0%)显著高于汉族(6.7%);异性性传播感染者和静脉注射吸毒感染者的CRF08 BC亚型均占总数的50.0%以上,但前者CRF01_AE的构成比占约30.0%,后者未知重组型和CRF07 BC的比例分别达到约15.0%.未知重组病毒株呈现两种重组模式,分别为B(B')/C重组和以CRF01 AE为母株嵌入B(B ')和/或C片段重组,并以前者为主(7